More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0007 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  57 
 
 		 606 aa  695    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  56.88 
 
 		 609 aa  706    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  56.35 
 
 		 604 aa  686    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  57.19 
 
 		 604 aa  699    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  61.37 
 
 		 588 aa  745    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  56.75 
 
 		 588 aa  687    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  59.56 
 
 		 589 aa  733    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  55.04 
 
 		 600 aa  681    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  63.01 
 
 		 589 aa  762    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  60 
 
 		 589 aa  728    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  100 
 
 		 584 aa  1186    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  59.49 
 
 		 590 aa  728    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  56.55 
 
 		 610 aa  694    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 586 aa  634  1e-180  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  52.64 
 
 		 590 aa  629  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  52.47 
 
 		 590 aa  627  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  52.47 
 
 		 590 aa  627  1e-178  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  51.44 
 
 		 592 aa  620  1e-176  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  51.53 
 
 		 590 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  50.17 
 
 		 601 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  43.9 
 
 		 595 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  46.9 
 
 		 604 aa  535  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  47.47 
 
 		 589 aa  532  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  46.96 
 
 		 590 aa  533  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  46.79 
 
 		 590 aa  529  1e-149  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  46.04 
 
 		 590 aa  524  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  42.83 
 
 		 600 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  43.34 
 
 		 600 aa  503  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  43.41 
 
 		 611 aa  501  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  43.29 
 
 		 603 aa  500  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  43.41 
 
 		 611 aa  501  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  40.74 
 
 		 623 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  42.89 
 
 		 564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  26.39 
 
 		 643 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  23.84 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  26.21 
 
 		 624 aa  108  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.59 
 
 		 557 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.59 
 
 		 557 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.59 
 
 		 557 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  24.32 
 
 		 653 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  25.37 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.55 
 
 		 555 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  25.15 
 
 		 644 aa  104  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.28 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  23.28 
 
 		 449 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.52 
 
 		 500 aa  104  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.06 
 
 		 558 aa  103  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.87 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.46 
 
 		 557 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  23.24 
 
 		 639 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  28.99 
 
 		 481 aa  100  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  27.08 
 
 		 767 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3690  ABC transporter, ATPase subunit  24.85 
 
 		 599 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  26.85 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  26.43 
 
 		 557 aa  99.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  23.94 
 
 		 638 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.68 
 
 		 554 aa  99.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  24.65 
 
 		 518 aa  99.8  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  23.82 
 
 		 623 aa  99  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0269  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.39 
 
 		 561 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  29.33 
 
 		 497 aa  99.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  24.94 
 
 		 634 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  24.71 
 
 		 557 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  25.93 
 
 		 644 aa  97.8  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  26.03 
 
 		 648 aa  97.8  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  24.36 
 
 		 542 aa  97.8  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.65 
 
 		 555 aa  97.4  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  25.24 
 
 		 540 aa  97.1  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.65 
 
 		 555 aa  97.1  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  25.88 
 
 		 646 aa  96.7  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  25.55 
 
 		 630 aa  96.3  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.48 
 
 		 561 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  26.16 
 
 		 497 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  27.07 
 
 		 544 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  30.03 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  25.15 
 
 		 643 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  23.17 
 
 		 543 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  27.02 
 
 		 632 aa  95.9  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  24.32 
 
 		 626 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  26.39 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  24.68 
 
 		 636 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  26.64 
 
 		 559 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  25.45 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.45 
 
 		 555 aa  95.5  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.76 
 
 		 560 aa  95.1  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.72 
 
 		 554 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  24.75 
 
 		 540 aa  94.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  23.93 
 
 		 549 aa  94.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.24 
 
 		 558 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  25.48 
 
 		 922 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 629 aa  94.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  26.08 
 
 		 641 aa  94.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  32.18 
 
 		 256 aa  94.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.3 
 
 		 555 aa  94.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  23.58 
 
 		 474 aa  94.4  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.33 
 
 		 268 aa  94  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  25.22 
 
 		 635 aa  94.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.74 
 
 		 559 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  32.6 
 
 		 217 aa  94  7e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3872  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.3 
 
 		 555 aa  94  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0797074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>