More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1568 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  100 
 
 		 589 aa  1204    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  56.78 
 
 		 604 aa  686    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  59.49 
 
 		 588 aa  702    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  75.38 
 
 		 590 aa  935    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  56.95 
 
 		 604 aa  684    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  69.56 
 
 		 588 aa  858    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  61.42 
 
 		 589 aa  712    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  56.26 
 
 		 606 aa  683    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  60 
 
 		 584 aa  696    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  55.15 
 
 		 610 aa  661    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  54.82 
 
 		 609 aa  669    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  69.1 
 
 		 600 aa  867    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  74.49 
 
 		 589 aa  919    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  51.96 
 
 		 590 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  51.79 
 
 		 590 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  52.3 
 
 		 590 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  49.91 
 
 		 586 aa  595  1e-169  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  51.36 
 
 		 592 aa  597  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  51.45 
 
 		 590 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  45.76 
 
 		 595 aa  566  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  48.33 
 
 		 601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  45.44 
 
 		 590 aa  514  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 600 aa  504  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  43.5 
 
 		 600 aa  505  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  43.84 
 
 		 590 aa  501  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  44.43 
 
 		 604 aa  499  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  44.07 
 
 		 590 aa  501  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  44.59 
 
 		 589 aa  498  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  43.38 
 
 		 603 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  42.15 
 
 		 623 aa  489  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  43.17 
 
 		 611 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  43.17 
 
 		 611 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0894318 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  41.41 
 
 		 564 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  25.54 
 
 		 646 aa  124  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  26.56 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  25.88 
 
 		 530 aa  108  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  25.79 
 
 		 544 aa  107  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  26.22 
 
 		 638 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.29 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  27.8 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  28.05 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  24.6 
 
 		 575 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  25.41 
 
 		 493 aa  104  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46540  ABC(ATP-binding) family transporter (Uup-like protein/duplicated ATPase)  27.59 
 
 		 549 aa  104  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.953997  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.63 
 
 		 558 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  24.79 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.76 
 
 		 600 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  26.53 
 
 		 603 aa  101  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  25.2 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 		 543 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.59 
 
 		 557 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  24.53 
 
 		 656 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  25.57 
 
 		 668 aa  100  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  27.65 
 
 		 482 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  24.41 
 
 		 529 aa  100  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  24 
 
 		 581 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  24.76 
 
 		 648 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  22.54 
 
 		 879 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  23.21 
 
 		 649 aa  99  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  24.34 
 
 		 555 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  24.27 
 
 		 539 aa  98.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.38 
 
 		 557 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  24.75 
 
 		 627 aa  97.8  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  24.2 
 
 		 640 aa  97.8  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  25.36 
 
 		 511 aa  98.2  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  32.5 
 
 		 577 aa  97.4  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  25.19 
 
 		 547 aa  97.4  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  27.11 
 
 		 563 aa  97.4  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  23.78 
 
 		 543 aa  97.1  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.79 
 
 		 560 aa  97.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  23.99 
 
 		 664 aa  97.4  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0214  peptide ABC transporter ATPase  26.17 
 
 		 569 aa  97.1  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  24.54 
 
 		 640 aa  97.1  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 557 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 557 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  27.36 
 
 		 559 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 557 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.17 
 
 		 560 aa  97.1  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  23.43 
 
 		 626 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  31.92 
 
 		 259 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  25.35 
 
 		 632 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  26.41 
 
 		 500 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  23.48 
 
 		 545 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  24.87 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  25.79 
 
 		 563 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  25.59 
 
 		 494 aa  95.5  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  27.07 
 
 		 551 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1310  ABC transporter related  26.09 
 
 		 622 aa  95.1  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.84 
 
 		 558 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  29.9 
 
 		 268 aa  95.1  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  25.15 
 
 		 502 aa  94.7  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.39 
 
 		 558 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  25.71 
 
 		 627 aa  94.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.9 
 
 		 561 aa  94.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  27.62 
 
 		 495 aa  94.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  24.65 
 
 		 628 aa  94.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.06 
 
 		 554 aa  94.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  24.65 
 
 		 628 aa  94.4  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.95 
 
 		 555 aa  94  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  25.81 
 
 		 632 aa  94  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>