More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0939 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  57.02 
 
 		 604 aa  690    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  59.45 
 
 		 588 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  100 
 
 		 589 aa  1201    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  58.07 
 
 		 606 aa  692    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  71.04 
 
 		 588 aa  872    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  56.88 
 
 		 610 aa  675    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  59.46 
 
 		 589 aa  711    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  56.72 
 
 		 609 aa  689    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  73.8 
 
 		 590 aa  921    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 604 aa  675    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  59.56 
 
 		 584 aa  699    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  74.49 
 
 		 589 aa  919    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  67.12 
 
 		 600 aa  840    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  51.96 
 
 		 590 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  51.96 
 
 		 590 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  51.44 
 
 		 590 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  51.61 
 
 		 590 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  50.85 
 
 		 592 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  49.49 
 
 		 586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  50.17 
 
 		 601 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  44.92 
 
 		 595 aa  559  1e-158  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  43.07 
 
 		 600 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  43.91 
 
 		 600 aa  515  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  45.35 
 
 		 590 aa  514  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  45.35 
 
 		 589 aa  511  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  44.93 
 
 		 590 aa  509  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  44.33 
 
 		 590 aa  507  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  43.72 
 
 		 611 aa  503  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  43.72 
 
 		 611 aa  503  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  42.19 
 
 		 623 aa  498  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  42.52 
 
 		 603 aa  491  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  44.37 
 
 		 604 aa  490  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0393541 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  41.32 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  25.34 
 
 		 645 aa  126  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  25.24 
 
 		 644 aa  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  29.35 
 
 		 495 aa  117  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  24.71 
 
 		 644 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  22.76 
 
 		 643 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  24.66 
 
 		 646 aa  114  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  23.24 
 
 		 643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  24.19 
 
 		 489 aa  112  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  25.73 
 
 		 653 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.72 
 
 		 481 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.45 
 
 		 557 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.45 
 
 		 557 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.45 
 
 		 557 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  27.59 
 
 		 921 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  27.19 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 		 560 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3690  ABC transporter, ATPase subunit  27.16 
 
 		 599 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  24 
 
 		 518 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  26.72 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  27.62 
 
 		 510 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  23.8 
 
 		 518 aa  104  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  26.68 
 
 		 922 aa  103  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.69 
 
 		 556 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4945  ABC transporter related  24.86 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  25.83 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.29 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  29.38 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  34.38 
 
 		 577 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46540  ABC(ATP-binding) family transporter (Uup-like protein/duplicated ATPase)  27.49 
 
 		 549 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.953997  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.36 
 
 		 557 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  24.86 
 
 		 640 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  27.77 
 
 		 587 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  27.43 
 
 		 505 aa  101  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  27.68 
 
 		 838 aa  101  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  25.45 
 
 		 566 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.29 
 
 		 560 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.81 
 
 		 560 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  24.75 
 
 		 628 aa  100  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  26.75 
 
 		 918 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.25 
 
 		 553 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  24.75 
 
 		 628 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 558 aa  100  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  26.71 
 
 		 557 aa  100  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 		 560 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  27.03 
 
 		 555 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  26.46 
 
 		 557 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 		 589 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.69 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  24.8 
 
 		 624 aa  99.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  25.05 
 
 		 607 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.48 
 
 		 561 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  25.05 
 
 		 607 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  22.95 
 
 		 620 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  26 
 
 		 705 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  26.27 
 
 		 863 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  27.13 
 
 		 543 aa  98.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.44 
 
 		 555 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.91 
 
 		 553 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.15 
 
 		 555 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  29 
 
 		 532 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  25.79 
 
 		 571 aa  97.8  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>