More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0528 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  78.61 
 
 
592 aa  966    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  100 
 
 
590 aa  1205    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  97.97 
 
 
590 aa  1185    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  82.71 
 
 
590 aa  1035    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  97.46 
 
 
590 aa  1174    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  51.96 
 
 
589 aa  619  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  52.55 
 
 
586 aa  618  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  54.42 
 
 
589 aa  615  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  51.62 
 
 
590 aa  610  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  51.96 
 
 
589 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  52.72 
 
 
588 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  52.47 
 
 
584 aa  598  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
604 aa  595  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  51.52 
 
 
601 aa  595  1e-169  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  50 
 
 
606 aa  592  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  49.16 
 
 
604 aa  594  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  48.59 
 
 
609 aa  589  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  50.08 
 
 
600 aa  588  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  50.59 
 
 
588 aa  586  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  47.85 
 
 
610 aa  567  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  47.22 
 
 
600 aa  567  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  46.39 
 
 
600 aa  551  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  45.82 
 
 
604 aa  545  1e-154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  46.98 
 
 
590 aa  538  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  44.84 
 
 
595 aa  537  1e-151  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  44.8 
 
 
623 aa  532  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  45.97 
 
 
590 aa  532  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  45.47 
 
 
590 aa  526  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  46.01 
 
 
611 aa  526  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  46.01 
 
 
611 aa  526  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  45.64 
 
 
589 aa  522  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  44.15 
 
 
603 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  43.51 
 
 
564 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  27.9 
 
 
645 aa  124  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  23.6 
 
 
646 aa  121  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 
489 aa  118  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  23.52 
 
 
643 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.79 
 
 
556 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.92 
 
 
554 aa  111  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  25.79 
 
 
644 aa  111  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  25.29 
 
 
643 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  25.19 
 
 
643 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  28.65 
 
 
537 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  25.1 
 
 
583 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  29.43 
 
 
502 aa  107  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.04 
 
 
554 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.01 
 
 
556 aa  106  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  24.9 
 
 
573 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  26.2 
 
 
482 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.47 
 
 
560 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  25.9 
 
 
555 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  28.57 
 
 
495 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.55 
 
 
554 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.84 
 
 
554 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2608  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 
579 aa  104  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.234433  normal  0.107182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  26.22 
 
 
478 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1200  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.11 
 
 
553 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.63 
 
 
559 aa  104  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.3 
 
 
555 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.49 
 
 
553 aa  103  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  26.93 
 
 
564 aa  103  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.5 
 
 
554 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  25.9 
 
 
626 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  23.46 
 
 
628 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.1 
 
 
553 aa  103  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 
555 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  22.7 
 
 
914 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.86 
 
 
563 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 
555 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  25.62 
 
 
540 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  23.45 
 
 
628 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  24.79 
 
 
510 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.67 
 
 
913 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.77 
 
 
705 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  30.73 
 
 
259 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  23.48 
 
 
644 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.76 
 
 
554 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  25.4 
 
 
466 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.14 
 
 
555 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  25.4 
 
 
466 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  24.49 
 
 
555 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.93 
 
 
560 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.23 
 
 
555 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  26.62 
 
 
647 aa  101  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  24.79 
 
 
543 aa  101  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.23 
 
 
555 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.23 
 
 
555 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.23 
 
 
555 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.23 
 
 
555 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.36 
 
 
555 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.23 
 
 
555 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  23.16 
 
 
538 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  25.52 
 
 
909 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 
570 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 
555 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.77 
 
 
555 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.73 
 
 
555 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.77 
 
 
555 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  24.6 
 
 
539 aa  100  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  32.8 
 
 
255 aa  100  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>