More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0623 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  513  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  54.55 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  52.38 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  53.97 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  52.38 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  52.19 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  49 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 252 aa  241  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6209  triosephosphate isomerase  51.68 
 
 		 242 aa  234  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.74008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 249 aa  228  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 646 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.46 
 
 		 655 aa  225  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  46.18 
 
 		 250 aa  224  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1507  hypothetical protein  41.9 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  46.37 
 
 		 257 aa  221  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 308 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  46.69 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  44.98 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  45.38 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  42.57 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 251 aa  214  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  47.67 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  43.03 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  45.88 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  46.37 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>