100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1651 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  100 
 
 		 392 aa  784    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  96.16 
 
 		 392 aa  738    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  78.97 
 
 		 393 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  80.88 
 
 		 392 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  74.23 
 
 		 409 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  74.55 
 
 		 393 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  72.24 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  72.24 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  72.24 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  72.24 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  72.24 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  72.24 
 
 		 393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  72.24 
 
 		 393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  72.24 
 
 		 393 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  71.98 
 
 		 393 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  72.24 
 
 		 393 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  72.24 
 
 		 393 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  71.98 
 
 		 393 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  72.24 
 
 		 393 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  72.24 
 
 		 393 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  61.58 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  61.58 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  61.58 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  61.32 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  61.58 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  61.58 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  61.58 
 
 		 394 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  61.22 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  53.32 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  53.32 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  53.32 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  52.97 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  52.97 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  52.97 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  52.97 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  52.97 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  52.97 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  52.58 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  54.34 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  50.28 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  47.29 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  39.34 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  35.6 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  33.53 
 
 		 359 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  28.36 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  29.37 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 431 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  39.42 
 
 		 160 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  23.86 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  29.49 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  23.26 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  32.14 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 447 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.85 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  28.03 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  23.68 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  22.27 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  21.86 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  24.92 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  24.43 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  23.95 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  30.88 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  30.88 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 385 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  30.88 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  30.88 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>