160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0153 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  100 
 
 		 367 aa  759    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  96.19 
 
 		 367 aa  736    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  83.57 
 
 		 365 aa  611  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  81.06 
 
 		 365 aa  597  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  76.16 
 
 		 365 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  76.16 
 
 		 371 aa  585  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  76.16 
 
 		 371 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  70.39 
 
 		 375 aa  527  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  68.04 
 
 		 370 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  68.6 
 
 		 370 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  68.6 
 
 		 370 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  68.32 
 
 		 370 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  68.04 
 
 		 370 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  68.04 
 
 		 370 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  67.68 
 
 		 370 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  67.77 
 
 		 370 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  67.4 
 
 		 370 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  64.85 
 
 		 370 aa  501  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  59.23 
 
 		 368 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  57.1 
 
 		 368 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  57.38 
 
 		 368 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  56.22 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  56.22 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  57.38 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  57.38 
 
 		 369 aa  421  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  57.7 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  56.55 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  55.71 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  54.6 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  57.03 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  53.35 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  56.82 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  53.78 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  56.67 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  49.86 
 
 		 371 aa  362  4e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  48.59 
 
 		 365 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  47.74 
 
 		 368 aa  352  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  47.66 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  47.18 
 
 		 371 aa  348  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  47.74 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  48.31 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  46.69 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  44.26 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  43.42 
 
 		 386 aa  302  6.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  42.46 
 
 		 347 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  42.46 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  40.96 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  40.4 
 
 		 346 aa  255  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  36.22 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  38.46 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  36.74 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  39.34 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  37.29 
 
 		 640 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  39.78 
 
 		 346 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  33.24 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  39.23 
 
 		 350 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  35.73 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  34.15 
 
 		 348 aa  229  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  34.79 
 
 		 624 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  35.05 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  34.16 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  33.33 
 
 		 347 aa  222  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  34.38 
 
 		 334 aa  222  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  33.15 
 
 		 350 aa  222  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  34.25 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  35.39 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  35.16 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  34.35 
 
 		 352 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.06 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  34.07 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.61 
 
 		 631 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  34.06 
 
 		 639 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  38.94 
 
 		 346 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  32.69 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  37.11 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  31.96 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  32.05 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  34.82 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.17 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  33.62 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  33.24 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  34.18 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  33.51 
 
 		 356 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  31.94 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  31.74 
 
 		 345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  35.96 
 
 		 336 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  37.43 
 
 		 374 aa  199  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  36.21 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  33.15 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  33.15 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  33.15 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  34.85 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  33.99 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  31.13 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  34.65 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  31.36 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  33.77 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  30.11 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  33.8 
 
 		 327 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>