More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  55.27 
 
 
864 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  67.89 
 
 
762 aa  990    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  54.71 
 
 
760 aa  761    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  68.77 
 
 
755 aa  988    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  51.73 
 
 
769 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  68.38 
 
 
793 aa  1025    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  53.14 
 
 
766 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  94.93 
 
 
764 aa  1405    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  55.27 
 
 
864 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  69.72 
 
 
789 aa  1039    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  58.93 
 
 
763 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  55.43 
 
 
864 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  57.17 
 
 
1079 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  69.74 
 
 
764 aa  1024    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  52.18 
 
 
769 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  55.27 
 
 
864 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  68.77 
 
 
767 aa  984    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 
769 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  55.27 
 
 
864 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  59.69 
 
 
768 aa  855    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  51.8 
 
 
769 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  42.84 
 
 
808 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  67.64 
 
 
765 aa  985    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  55.43 
 
 
864 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  52.7 
 
 
804 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  52.05 
 
 
769 aa  696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  100 
 
 
769 aa  1508    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  51.8 
 
 
769 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  54.75 
 
 
832 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  45.65 
 
 
752 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
896 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
896 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
742 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
679 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
679 aa  360  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.6 
 
 
734 aa  355  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
741 aa  353  7e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
784 aa  330  8e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
762 aa  327  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  40.13 
 
 
878 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  30.72 
 
 
764 aa  327  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
740 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.22 
 
 
769 aa  313  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
2539 aa  313  7.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
772 aa  312  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  29.87 
 
 
770 aa  308  3e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  39.31 
 
 
2458 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  28.22 
 
 
769 aa  306  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.38 
 
 
1971 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  39.31 
 
 
2476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  28.08 
 
 
769 aa  305  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.01 
 
 
2336 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
1646 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
777 aa  299  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
801 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
2212 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
1646 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
2423 aa  296  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
1647 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  29.23 
 
 
2301 aa  292  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.67 
 
 
1992 aa  290  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  29.49 
 
 
764 aa  289  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
758 aa  289  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
1629 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
756 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
705 aa  283  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
777 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  28.7 
 
 
798 aa  282  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
777 aa  281  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  28.59 
 
 
1987 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  32.1 
 
 
770 aa  279  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
705 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.63 
 
 
2301 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
1974 aa  279  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
781 aa  278  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.33 
 
 
785 aa  277  6e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.12 
 
 
783 aa  276  7e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
750 aa  277  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
783 aa  276  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  34.45 
 
 
839 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
865 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
1758 aa  275  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
753 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
865 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
1155 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
756 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
1609 aa  272  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
974 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
706 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.04 
 
 
1960 aa  270  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  28.02 
 
 
2284 aa  270  8.999999999999999e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
695 aa  269  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.49 
 
 
1956 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
1031 aa  268  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
686 aa  267  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
707 aa  267  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
1127 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
934 aa  263  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  27.62 
 
 
803 aa  263  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
1832 aa  261  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>