More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  97.51 
 
 
646 aa  1302  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  76.17 
 
 
689 aa  999  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  73.45 
 
 
741 aa  891  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  81.95 
 
 
741 aa  980  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  100 
 
 
643 aa  1330  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  83.69 
 
 
689 aa  991  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  82.48 
 
 
741 aa  986  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  45.48 
 
 
734 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  45.48 
 
 
734 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  45.48 
 
 
734 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  45.48 
 
 
734 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  44.15 
 
 
771 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.79673e-08 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  45.48 
 
 
734 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  45.75 
 
 
731 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  45.32 
 
 
734 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  42.86 
 
 
645 aa  506  1e-142  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  45.75 
 
 
731 aa  506  1e-142  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  44.46 
 
 
734 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  44.13 
 
 
734 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  45.72 
 
 
757 aa  493  1e-138  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  40.84 
 
 
796 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  44.67 
 
 
778 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  41.15 
 
 
676 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  45.03 
 
 
794 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  42.78 
 
 
907 aa  470  1e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  38.83 
 
 
683 aa  469  1e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  39.87 
 
 
683 aa  469  1e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  43.37 
 
 
792 aa  466  1e-130  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  41.88 
 
 
774 aa  465  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  41.82 
 
 
748 aa  465  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  39.75 
 
 
777 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  41.88 
 
 
756 aa  459  1e-128  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  41.08 
 
 
788 aa  460  1e-128  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  44.56 
 
 
730 aa  459  1e-128  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  41.92 
 
 
755 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  41.99 
 
 
572 aa  453  1e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  40.68 
 
 
645 aa  452  1e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  40.16 
 
 
780 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  39.34 
 
 
712 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  38.37 
 
 
619 aa  446  1e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  44.19 
 
 
785 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  39.65 
 
 
767 aa  439  1e-122  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  39.65 
 
 
767 aa  441  1e-122  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  45.44 
 
 
838 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  41.39 
 
 
794 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 
724 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  45.24 
 
 
841 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  45.24 
 
 
841 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  44.84 
 
 
841 aa  432  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  38.63 
 
 
725 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  38.78 
 
 
687 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  38.85 
 
 
769 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  43.32 
 
 
975 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  38.29 
 
 
743 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  37.72 
 
 
735 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  38.13 
 
 
730 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  39.71 
 
 
1981 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  38.56 
 
 
729 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  36.79 
 
 
1057 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  38.56 
 
 
729 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  42.56 
 
 
886 aa  409  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  37.79 
 
 
661 aa  406  1e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  37.17 
 
 
661 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 
661 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 
661 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 
661 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  37.63 
 
 
661 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  41.6 
 
 
901 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 
661 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  36.19 
 
 
858 aa  399  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  36.99 
 
 
1048 aa  400  1e-110  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  36.19 
 
 
930 aa  399  1e-110  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  40.58 
 
 
783 aa  400  1e-110  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  39.3 
 
 
714 aa  402  1e-110  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  36.19 
 
 
896 aa  399  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  36.19 
 
 
872 aa  402  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  37.04 
 
 
613 aa  400  1e-110  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  37.52 
 
 
661 aa  402  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 
703 aa  400  1e-110  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  40.03 
 
 
775 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  39.48 
 
 
775 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  36.79 
 
 
753 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  40.03 
 
 
775 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  39.48 
 
 
775 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  39.48 
 
 
775 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  39.48 
 
 
775 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  40.03 
 
 
775 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  36.17 
 
 
641 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  34.43 
 
 
618 aa  389  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  36.22 
 
 
618 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 
618 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  36.61 
 
 
874 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  36.61 
 
 
916 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  36.61 
 
 
922 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  36.09 
 
 
668 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  36.14 
 
 
668 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  37.52 
 
 
611 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  35.69 
 
 
669 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  34.83 
 
 
616 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  34.86 
 
 
1003 aa  365  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>