More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15631 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  100 
 
 
440 aa  887    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  60.69 
 
 
441 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.14 
 
 
440 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  45.91 
 
 
440 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  51.63 
 
 
420 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  50.9 
 
 
431 aa  351  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  39.68 
 
 
413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  38.48 
 
 
413 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.75 
 
 
413 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  37.41 
 
 
413 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.07 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  31.55 
 
 
475 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  33.85 
 
 
484 aa  203  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  33.17 
 
 
489 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.19 
 
 
492 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.57 
 
 
566 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  31.07 
 
 
479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  31.07 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  32.23 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  33.42 
 
 
448 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  32.41 
 
 
448 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  30.1 
 
 
462 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  36.86 
 
 
469 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.57 
 
 
457 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  29.78 
 
 
481 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  26.41 
 
 
529 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.25 
 
 
517 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  25.76 
 
 
531 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  25.76 
 
 
531 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.33 
 
 
513 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  25.86 
 
 
520 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  28.57 
 
 
529 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.9 
 
 
499 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  31.41 
 
 
499 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  25.62 
 
 
506 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  27.27 
 
 
545 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.8 
 
 
529 aa  107  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  30.19 
 
 
499 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.38 
 
 
517 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  29.75 
 
 
532 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  28.3 
 
 
516 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.03 
 
 
517 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.96 
 
 
496 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.25 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  26.2 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.95 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  24.48 
 
 
492 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  33.14 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 
470 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  34.88 
 
 
460 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  33.88 
 
 
398 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  35.56 
 
 
308 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  36 
 
 
474 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  31.62 
 
 
305 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  22.81 
 
 
463 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  29.5 
 
 
299 aa  61.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  35.25 
 
 
490 aa  61.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  35.34 
 
 
453 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  22.81 
 
 
463 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  35.71 
 
 
300 aa  60.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  35.54 
 
 
474 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.96 
 
 
679 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  37.19 
 
 
476 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2981  ribosome-associated GTPase EngA  30.81 
 
 
447 aa  60.1  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  23.65 
 
 
481 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  34.56 
 
 
473 aa  58.5  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  33.61 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  32.79 
 
 
483 aa  58.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  32.79 
 
 
483 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  34.71 
 
 
473 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  30.57 
 
 
302 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  33.06 
 
 
296 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  31.71 
 
 
473 aa  57.4  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  37.7 
 
 
463 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  31.46 
 
 
461 aa  57  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 
470 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  38.02 
 
 
408 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  35 
 
 
303 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  33.06 
 
 
458 aa  56.6  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  28.15 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  30.94 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  32.87 
 
 
312 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0617  hypothetical protein  27.12 
 
 
210 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5057  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1233  small GTP-binding protein  36.07 
 
 
458 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.765411  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  34.45 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  27.38 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  34.15 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  33.53 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  34.81 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  35.54 
 
 
478 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  28.87 
 
 
297 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  28.86 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  28.86 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  29.08 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  31.4 
 
 
483 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>