More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1296 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  778    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  62.11 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  64.33 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  64.33 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  64.04 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  65.17 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  56.02 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  59.41 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  54.61 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  60.5 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  56.42 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  52.85 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  55.47 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  54.87 
 
 		 565 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  52.53 
 
 		 568 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  52.14 
 
 		 402 aa  311  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  51.13 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  51.47 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  51.77 
 
 		 431 aa  278  9e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  53.09 
 
 		 424 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  44.35 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  36.56 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  36.56 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  36.83 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  36.56 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  36.56 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  37.95 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  36.83 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  37.1 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  36.83 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 368 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  26.85 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  26.3 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  26.58 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  26.58 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  26.58 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 		 518 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  30.45 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  31.46 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.79 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.79 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.79 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.7 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.03 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.03 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.03 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.38 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.57 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.24 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.42 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.89 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.67 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  27.33 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.96 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  31.15 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3389  hypothetical protein  32.37 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.33 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>