More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0873 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 315 aa  610  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  34.11 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  40.46 
 
 		 823 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3397  PfkB domain protein  35.03 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.125463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  33.67 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3125  PfkB domain protein  34.23 
 
 		 309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  31.63 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  36.86 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  30.4 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  31.31 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  30.65 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  29.78 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  29.47 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  33.79 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  29.93 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  24.68 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  31.39 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  35.46 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  31.23 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.6 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.25 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.94 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.84 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  32 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.1 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  28.91 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.07 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  31.13 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  32.22 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  32.85 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.99 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.08 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.37 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.37 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.01 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.37 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  30.22 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.37 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  30.09 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  29.72 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  29.22 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.01 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  29.57 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  30.72 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.66 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  32.95 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  32.49 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  32.79 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.8 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  24.76 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  25.86 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  33.05 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.17 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.88 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  32.91 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  29.37 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  30.09 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  30.85 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  24.3 
 
 		 628 aa  69.3  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  30.8 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  29.83 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  33.09 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  29.39 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  28.04 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  41.22 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  30.07 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  32.55 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  26.09 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  30.56 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  24.3 
 
 		 628 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  29.69 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  31.03 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  28.48 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  27.6 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  30.35 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  27.42 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  33.22 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  30.63 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.75 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  29.14 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  30.5 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  27.97 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  29.56 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  31.38 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  26.69 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  30.21 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.64 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>