More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3397 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3397  PfkB domain protein  100 
 
 		 309 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.125463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3125  PfkB domain protein  87.66 
 
 		 309 aa  527  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  68.98 
 
 		 311 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  44.3 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  35.03 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  35.53 
 
 		 823 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  24.32 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.83 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  23.86 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  27.5 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  23.86 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.28 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  29.75 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  27.85 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  27.6 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  30.29 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5796  PfkB domain protein  27.51 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  23.68 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.74 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  28.11 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.41 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  28.33 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  23.62 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  29.78 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  27.72 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  29.78 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  29.59 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  29.78 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  23.24 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  23.24 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  23.24 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  29.78 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  31.12 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  22.93 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.62 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  29.41 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  32 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  28.99 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  28.71 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  26.74 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.69 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  26.62 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  29.92 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  32.39 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  28.41 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  28.71 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  26.94 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  26.94 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  30.41 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  25.84 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  28.3 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  28.35 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  31.69 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  26.09 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.65 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.42 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  28.66 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  31.69 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  26.6 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  24.22 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  25.47 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  28.46 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  22.56 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  28.33 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  28.33 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  30.8 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  24.59 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.16 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  28.96 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.51 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.74 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  26.33 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  24.28 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  29.71 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  28 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.08 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.87 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.48 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  30.5 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  30.97 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  27.3 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  25.58 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  30.5 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  21.66 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  27.69 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  26.56 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>