More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3125 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3125  PfkB domain protein  100 
 
 		 309 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3397  PfkB domain protein  87.66 
 
 		 309 aa  527  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.125463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  68.83 
 
 		 311 aa  424  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  44.63 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  34.23 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  35.4 
 
 		 823 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  29.05 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  25.78 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  28.42 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.74 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  24.05 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  32.13 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  23.73 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.62 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5796  PfkB domain protein  27.96 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  27.93 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  26.07 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  28.95 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  26.6 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.31 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.72 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  29.73 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.42 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.77 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  28.67 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  30.8 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.77 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.77 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.77 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  29.31 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  28.25 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  30.22 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.11 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  26.72 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  26.88 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  26.77 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  29.39 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  28.67 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  29.39 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  28.99 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  34.62 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  30.23 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  26.59 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  27.68 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  24.38 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  25.75 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  27.69 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  26.07 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  27.18 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  25.6 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  28.06 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.42 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  27.44 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  27.04 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  23.29 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  23.29 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  28.99 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  23.29 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  22.56 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  25.68 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  28.15 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  22.35 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  25.75 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  25.16 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  33.04 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  24.18 
 
 		 401 aa  57  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.47 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  26.12 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.15 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  26.12 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  27.8 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  26.19 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  27.89 
 
 		 645 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  27.53 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  27.11 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  26.81 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  25.15 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.49 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  25.6 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  25.93 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  24.75 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  27.12 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  27.45 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  25 
 
 		 645 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  26.12 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  23.76 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  27.54 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  26.81 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  24.39 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  25.5 
 
 		 424 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  22.35 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  24.76 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>