More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4755 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 227 aa  446  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  56.67 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  53 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  48.1 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  42.99 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  47.31 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  39.41 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 396 aa  99  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  36.02 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 237 aa  88.2  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  39.11 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>