263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0529 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  100 
 
 		 206 aa  427  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  65.84 
 
 		 216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  63.73 
 
 		 206 aa  274  8e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  61.5 
 
 		 204 aa  266  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  59.8 
 
 		 203 aa  261  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  58.71 
 
 		 205 aa  250  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  56.16 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  57.71 
 
 		 205 aa  248  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  60.2 
 
 		 205 aa  247  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  59.3 
 
 		 203 aa  246  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  57.5 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  60 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  55.67 
 
 		 209 aa  244  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  55.67 
 
 		 209 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  61 
 
 		 206 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  59.3 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  56.93 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  58.29 
 
 		 204 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  58.29 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  55.88 
 
 		 204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  56.44 
 
 		 204 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  57.5 
 
 		 203 aa  240  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  58.29 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  57.71 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  56.78 
 
 		 207 aa  238  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  56.78 
 
 		 204 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  57.28 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  54.46 
 
 		 205 aa  235  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  57.21 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  54.73 
 
 		 206 aa  234  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  57 
 
 		 204 aa  234  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  56.72 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  55.72 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  56.72 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  57.07 
 
 		 208 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  55.72 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  55.72 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  56.5 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  55.5 
 
 		 208 aa  227  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  56.5 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  56.99 
 
 		 205 aa  224  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  52.26 
 
 		 205 aa  222  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  52.26 
 
 		 205 aa  222  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  52.26 
 
 		 205 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  55.5 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  52.11 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  48.98 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  51.02 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  51.31 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  48.7 
 
 		 209 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  48.69 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  48.76 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  48.69 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  47.6 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  49.21 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  48.69 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  43.96 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  49.47 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  47.4 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  44.93 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  44.66 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  44.17 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  44.39 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  35.9 
 
 		 550 aa  89.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  33.12 
 
 		 392 aa  85.9  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  33.54 
 
 		 389 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  32.05 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  32.12 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  32.05 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  33.33 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  32.41 
 
 		 394 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  33.33 
 
 		 393 aa  78.6  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  31.87 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.98 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.98 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  31.58 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  31.52 
 
 		 384 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  32.91 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.35 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  31.52 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  31.14 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  32.41 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  29.94 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  32.53 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  32.69 
 
 		 405 aa  72  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  31.32 
 
 		 381 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  30.06 
 
 		 384 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  30.25 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  31.06 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  33.33 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  30.52 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  30.67 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  29.65 
 
 		 388 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  28.85 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  36.55 
 
 		 925 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6686  Ribonuclease D  33.54 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  31.65 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  31.94 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  29.7 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>