More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1184 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  72.24 
 
 
548 aa  749    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  72.24 
 
 
548 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  72.24 
 
 
548 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  100 
 
 
544 aa  1085    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  40.34 
 
 
542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  39.12 
 
 
542 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  41.04 
 
 
535 aa  299  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  39.19 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  40.04 
 
 
538 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  32.96 
 
 
574 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  39.5 
 
 
545 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  34.97 
 
 
569 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  34.39 
 
 
541 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  37.2 
 
 
553 aa  240  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.11 
 
 
553 aa  230  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  31.89 
 
 
546 aa  229  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.7 
 
 
603 aa  227  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  32.51 
 
 
548 aa  226  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.47 
 
 
560 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.65 
 
 
565 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  32.07 
 
 
616 aa  216  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  32.54 
 
 
608 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  33.09 
 
 
573 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  30.5 
 
 
552 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  36.27 
 
 
568 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  30.57 
 
 
550 aa  210  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.78 
 
 
556 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  32.02 
 
 
569 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  29.98 
 
 
539 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32 
 
 
620 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  31.42 
 
 
556 aa  208  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  32.65 
 
 
564 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.76 
 
 
532 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.63 
 
 
530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  31.99 
 
 
613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  30.71 
 
 
564 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  30.9 
 
 
576 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  31.3 
 
 
527 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  31.8 
 
 
573 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.95 
 
 
543 aa  196  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.57 
 
 
619 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
560 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.15 
 
 
556 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  33.09 
 
 
580 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.45 
 
 
557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  32.91 
 
 
580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  29.95 
 
 
585 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  30.05 
 
 
606 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.42 
 
 
553 aa  188  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.24 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  31.93 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  35 
 
 
574 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  30.41 
 
 
543 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.14 
 
 
583 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 
543 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.14 
 
 
583 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  29.8 
 
 
560 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  30.3 
 
 
569 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  33.47 
 
 
544 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  28.38 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  30.27 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.24 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  33.02 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  28.42 
 
 
555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  28.38 
 
 
583 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  31.8 
 
 
550 aa  173  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  31.79 
 
 
550 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.33 
 
 
546 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.34 
 
 
542 aa  170  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.35 
 
 
584 aa  170  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  35.25 
 
 
565 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.55 
 
 
522 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.88 
 
 
522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.78 
 
 
544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.69 
 
 
522 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.31 
 
 
522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  29.89 
 
 
576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  32.36 
 
 
560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  31.51 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.64 
 
 
583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.84 
 
 
522 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  26.75 
 
 
582 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.5 
 
 
522 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  27.88 
 
 
522 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  28.21 
 
 
522 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.57 
 
 
544 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  29.29 
 
 
565 aa  163  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.65 
 
 
520 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.83 
 
 
545 aa  163  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  29.11 
 
 
568 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.15 
 
 
589 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  34.08 
 
 
536 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  27.65 
 
 
563 aa  160  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.31 
 
 
522 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.31 
 
 
522 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  31.16 
 
 
565 aa  160  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.39 
 
 
547 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  30.83 
 
 
575 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.57 
 
 
558 aa  156  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>