More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0234 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  78.57 
 
 		 228 aa  349  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  78.12 
 
 		 228 aa  347  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  78.12 
 
 		 228 aa  347  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  60.55 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.76 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.26 
 
 		 242 aa  221  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  52.63 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.12 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.7 
 
 		 258 aa  201  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  49.32 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  52 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.22 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.22 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  48.88 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  45.74 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  47.98 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  46.4 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  47.09 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  46.4 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  51.36 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  47.53 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  49.55 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  48.43 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  48.88 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  47.09 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  47.75 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  42.49 
 
 		 245 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  42.98 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.08 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 247 aa  121  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  37.39 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 270 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 317 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.24 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  38.24 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  32.79 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  39.01 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 		 276 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 274 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  36 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1225  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  31.03 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0945  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 		 338 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  33.86 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20980  putative short chain dehydrogenas  36.84 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 		 276 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 		 275 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 266 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 284 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 274 aa  98.6  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.21 
 
 		 281 aa  98.2  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  34.97 
 
 		 847 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 282 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>