More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0565 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  315  2e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  37.67 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 325 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  44.59 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  32.86 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  34.21 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 371 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 334 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  40.24 
 
 		 243 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  48 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 204 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  41.89 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  43.08 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  53.57 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  43.94 
 
 		 277 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  39.02 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 		 251 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  35.79 
 
 		 277 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  39.51 
 
 		 191 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  39.53 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  41.56 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  41.56 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  41.56 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  41.56 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  41.56 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  34.09 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  43.86 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  37.31 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3926  transcriptional regulator PadR-like  43.86 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1595  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 254 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0257  PadR-like family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.688935 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>