159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0071 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  100 
 
 		 348 aa  710    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  62.54 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  57.27 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  49.71 
 
 		 348 aa  332  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  49.71 
 
 		 348 aa  326  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  50.43 
 
 		 342 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  45.93 
 
 		 348 aa  302  5.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  46.22 
 
 		 347 aa  301  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  45.51 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  40.65 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  43.15 
 
 		 352 aa  288  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  42.45 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  44.09 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  42.29 
 
 		 624 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  43.35 
 
 		 640 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  43.39 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  42.57 
 
 		 349 aa  278  8e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  42.41 
 
 		 631 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  42.82 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  44.54 
 
 		 334 aa  272  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  41.28 
 
 		 346 aa  268  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  41.79 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  40.58 
 
 		 639 aa  260  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  43.39 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  42.86 
 
 		 356 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  38.9 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  39.89 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  41.18 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  42.09 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  38.11 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  39.18 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  38.23 
 
 		 369 aa  245  9e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  40.51 
 
 		 370 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  37.32 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  40.69 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  37.68 
 
 		 347 aa  242  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  40.29 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  36.21 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  41.08 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  39.48 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  38.19 
 
 		 368 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  37.09 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  36.67 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  41.95 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  39.64 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.6 
 
 		 348 aa  232  6e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  37.7 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.76 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  37.98 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  36.16 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  38.86 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  37.75 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  40.29 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  39.02 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  38.19 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  34.81 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  35.15 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  34.81 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  34.81 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  34.79 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  39.01 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  40.11 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  37.68 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  40.82 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.52 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  32.04 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  34.52 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  39.37 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  39 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  36.67 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  40.58 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  40.58 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  37.93 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  38.84 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.57 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  32.69 
 
 		 366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  38.42 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  34.07 
 
 		 375 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  38.84 
 
 		 376 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  36.76 
 
 		 346 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.24 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  40.11 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  38.9 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  37.86 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  39.54 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  33.7 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  41.02 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  33.24 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  36.76 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  34.44 
 
 		 374 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  37.36 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  32.44 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  36.77 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.24 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  38.44 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.94 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  41.24 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.41 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>