100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0594 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  74.04 
 
 		 236 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  78.26 
 
 		 204 aa  298  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  59.9 
 
 		 207 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  59.42 
 
 		 207 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  49.44 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  45.41 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  45.41 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  45.41 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  45.41 
 
 		 184 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  45.41 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  45.51 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  44.32 
 
 		 184 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.11 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  40.68 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  44.32 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  42.51 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  37.57 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  41.81 
 
 		 187 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 		 185 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  33.17 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  40.68 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  40.68 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  40.68 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.68 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  40.68 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  40.68 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  40.11 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  36.16 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.59 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  37.72 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  33.91 
 
 		 181 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  32.74 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.97 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  31.93 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.94 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  29.26 
 
 		 189 aa  88.2  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  29.79 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  31.18 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  36.5 
 
 		 859 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  28.19 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  31.79 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  26.4 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  25.83 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  26.8 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  27.7 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  27.7 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.25 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.72 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.66 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.25 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  29.82 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  29.82 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  29.82 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  26.75 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  30.91 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  32.38 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  30.13 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  29.48 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  29.48 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  29.48 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  25.88 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  26.81 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  31.37 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  32.84 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  24.77 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  25.68 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.44 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  24.12 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.52 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  27.48 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  25.62 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  26.52 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  26.52 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.03 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  27.39 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  25.38 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  25.38 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  25.38 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  25.71 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  27.94 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.98 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  25.87 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.35 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  23.2 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  23.2 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  23.2 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  23.23 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>