More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4560 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  73.91 
 
 		 590 aa  857    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2681  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.34 
 
 		 626 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  100 
 
 		 594 aa  1179    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  74.32 
 
 		 590 aa  863    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.17 
 
 		 602 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4072  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.41 
 
 		 604 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4744  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  58.93 
 
 		 599 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1325  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.34 
 
 		 602 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3736  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  60.14 
 
 		 593 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0954  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.1 
 
 		 596 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  61.27 
 
 		 599 aa  752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  77.57 
 
 		 591 aa  907    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  62.24 
 
 		 600 aa  724    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  89.41 
 
 		 595 aa  1014    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  73.91 
 
 		 590 aa  857    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.23 
 
 		 595 aa  508  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  42.34 
 
 		 597 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.7 
 
 		 599 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.32 
 
 		 597 aa  482  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  41.45 
 
 		 585 aa  458  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3841  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40.41 
 
 		 587 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  40 
 
 		 583 aa  442  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4169  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  39.72 
 
 		 587 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.81 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.81 
 
 		 571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.63 
 
 		 571 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.63 
 
 		 571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.63 
 
 		 571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.63 
 
 		 571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  36.57 
 
 		 609 aa  303  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.45 
 
 		 571 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  37.71 
 
 		 584 aa  301  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  37.14 
 
 		 612 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  36.78 
 
 		 572 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 		 571 aa  297  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  44 
 
 		 567 aa  296  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.91 
 
 		 571 aa  296  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  43.73 
 
 		 567 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  34.5 
 
 		 576 aa  296  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.45 
 
 		 567 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  37.68 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  36.14 
 
 		 575 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.42 
 
 		 597 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.06 
 
 		 622 aa  293  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  34.56 
 
 		 636 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 629 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.3 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  37.17 
 
 		 582 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.45 
 
 		 627 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 622 aa  291  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  34.16 
 
 		 572 aa  291  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.28 
 
 		 768 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  35.67 
 
 		 920 aa  289  9e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.66 
 
 		 764 aa  289  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  33.89 
 
 		 572 aa  289  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.89 
 
 		 572 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  33.89 
 
 		 572 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  33.16 
 
 		 652 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  31.26 
 
 		 619 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  34.44 
 
 		 609 aa  286  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.53 
 
 		 594 aa  286  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 572 aa  286  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.27 
 
 		 579 aa  286  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  32.94 
 
 		 814 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  32.94 
 
 		 768 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.19 
 
 		 590 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  38.14 
 
 		 610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  32.85 
 
 		 784 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.12 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  35.04 
 
 		 726 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 640 aa  283  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 632 aa  283  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.75 
 
 		 602 aa  282  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  37.65 
 
 		 582 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  37.65 
 
 		 582 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  33.78 
 
 		 784 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  30.9 
 
 		 582 aa  282  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.79 
 
 		 572 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  34.24 
 
 		 672 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  42.26 
 
 		 578 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  37.4 
 
 		 589 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  35.36 
 
 		 770 aa  280  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  41.69 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  35.36 
 
 		 750 aa  280  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  36.33 
 
 		 606 aa  280  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  34.13 
 
 		 778 aa  280  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.22 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  33.95 
 
 		 589 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.61 
 
 		 597 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.3 
 
 		 574 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  41.73 
 
 		 565 aa  277  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.3 
 
 		 574 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  35.97 
 
 		 651 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  34.13 
 
 		 620 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  33.88 
 
 		 663 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 628 aa  277  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  31.37 
 
 		 586 aa  277  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  34.65 
 
 		 760 aa  276  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>