More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2893 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  93.68 
 
 		 269 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3746  exodeoxyribonuclease III Xth  81.78 
 
 		 269 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.0169792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4400  exodeoxyribonuclease III Xth  79.93 
 
 		 269 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.299594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4030  exodeoxyribonuclease III Xth  79.93 
 
 		 269 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4512  exodeoxyribonuclease III Xth  79.93 
 
 		 269 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0092  exodeoxyribonuclease III (xth)  59.41 
 
 		 293 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209408  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  59.04 
 
 		 295 aa  339  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0278  exodeoxyribonuclease III (xth)  60.89 
 
 		 270 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0179  putative exodeoxyribonuclease III (xthA)  58.3 
 
 		 271 aa  331  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0444  exodeoxyribonuclease III Xth  59.41 
 
 		 272 aa  330  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.0814808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0284  exodeoxyribonuclease III Xth  57.56 
 
 		 270 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.27736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  58.15 
 
 		 289 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  58.15 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  59.04 
 
 		 352 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0379  exodeoxyribonuclease III  57.72 
 
 		 270 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0962  exodeoxyribonuclease III Xth  57.04 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  54.35 
 
 		 290 aa  322  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  58.09 
 
 		 268 aa  321  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0330  exodeoxyribonuclease III Xth  57.04 
 
 		 270 aa  314  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0159885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  54.81 
 
 		 267 aa  311  9e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0095  exodeoxyribonuclease III  55.3 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  56.09 
 
 		 268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  56.44 
 
 		 284 aa  304  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4090  exodeoxyribonuclease III Xth  54.98 
 
 		 267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3766  exodeoxyribonuclease III Xth  54.98 
 
 		 267 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0036  exodeoxyribonuclease III  53.53 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000572838 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0414  exodeoxyribonuclease III Xth  54.1 
 
 		 267 aa  288  9e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0421  exodeoxyribonuclease III  50.93 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0053  exodeoxyribonuclease III  50.93 
 
 		 262 aa  281  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  54.89 
 
 		 270 aa  281  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  52.04 
 
 		 262 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24469  hitchhiker  0.00159144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2506  exodeoxyribonuclease III Xth  50.93 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550237  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2372  exodeoxyribonuclease III Xth  51.31 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0848  exodeoxyribonuclease III  50.93 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0490344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2671  exodeoxyribonuclease III (xth)  48.13 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.301429  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2948  exodeoxyribonuclease III  51.27 
 
 		 270 aa  265  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3788  exodeoxyribonuclease III Xth  47.76 
 
 		 285 aa  262  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996968  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5009  exodeoxyribonuclease III Xth  49.27 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  47.57 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3696  exodeoxyribonuclease III xth  48.55 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  37.73 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  37.68 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  37.32 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  36.9 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  35.16 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  35.42 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  36.9 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  37.04 
 
 		 261 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  37.78 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  34.8 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  35.4 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  35.4 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  35.42 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  36.03 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  35.06 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  34.19 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  35.82 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  35.06 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  36.53 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  39.41 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  36.76 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  37.55 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  35.06 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  36.63 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  34.17 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  36.82 
 
 		 322 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  34.69 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  35.97 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  36.8 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.58 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  35.66 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  34.67 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  34.81 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.59 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  38.97 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  34.4 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  36.26 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  36.3 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  34.81 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.9 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  35.9 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  35.29 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  35.53 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  35.9 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  36.04 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  35.77 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  30.5 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  35.16 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>