234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0812 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
353 aa  709    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  70.85 
 
 
375 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  80 
 
 
339 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  70.62 
 
 
354 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  49.39 
 
 
348 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  52.17 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  49.85 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  51.66 
 
 
366 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  51.01 
 
 
355 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  51.01 
 
 
355 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  50.67 
 
 
355 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  43.32 
 
 
353 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  49.1 
 
 
381 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  42.06 
 
 
353 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  46.52 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  43.11 
 
 
384 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  35.75 
 
 
342 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 
340 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  34.27 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
355 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
355 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  32.2 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  32.2 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  32.91 
 
 
335 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  32.63 
 
 
357 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  29.33 
 
 
577 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.28 
 
 
632 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.04 
 
 
672 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.96 
 
 
656 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.16 
 
 
622 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 
589 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  27.83 
 
 
971 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  28.37 
 
 
701 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
575 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  28.96 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.96 
 
 
575 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.4 
 
 
618 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 
593 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.14 
 
 
618 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.77 
 
 
650 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 
699 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  29.74 
 
 
553 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 
645 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.01 
 
 
637 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  28.35 
 
 
592 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.07 
 
 
658 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 
712 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30 
 
 
744 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  29.95 
 
 
641 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.37 
 
 
701 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.53 
 
 
1089 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 
729 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  25.46 
 
 
758 aa  62.8  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  24.88 
 
 
701 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 
702 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  26.04 
 
 
636 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.39 
 
 
737 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
724 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 
447 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  28.26 
 
 
632 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 
464 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  27.67 
 
 
643 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  25.23 
 
 
758 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  30.38 
 
 
407 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.02 
 
 
585 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  26.17 
 
 
741 aa  60.1  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.92 
 
 
440 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.34 
 
 
758 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 
746 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  26.88 
 
 
1020 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
592 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  26.7 
 
 
969 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  25.25 
 
 
752 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 
641 aa  59.3  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
558 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  27.39 
 
 
760 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.13 
 
 
694 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.98 
 
 
753 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 
410 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  26.47 
 
 
756 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  30.34 
 
 
447 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  28.57 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  28.82 
 
 
574 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  27.51 
 
 
561 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.19 
 
 
465 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.66 
 
 
611 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.78 
 
 
648 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
421 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  26.34 
 
 
665 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>