80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3288 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  350  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  43.03 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  38.38 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  30.3 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  30.91 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  28.92 
 
 		 376 aa  57.8  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  42.11 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  37.25 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  37.25 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  27.81 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  37.93 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  32.37 
 
 		 390 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  30.81 
 
 		 367 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  30.81 
 
 		 367 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  26.79 
 
 		 370 aa  53.9  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  31.36 
 
 		 367 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  35.16 
 
 		 394 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 372 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  27.09 
 
 		 425 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  37.63 
 
 		 383 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  27.59 
 
 		 216 aa  51.2  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  33 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  27.59 
 
 		 216 aa  50.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  39.8 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  35.19 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  27.59 
 
 		 216 aa  50.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  35.78 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  38.1 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  37.23 
 
 		 350 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  39.51 
 
 		 366 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  33.9 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  29.22 
 
 		 355 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  36.04 
 
 		 289 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  35.11 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  36 
 
 		 354 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  31.9 
 
 		 292 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  32.97 
 
 		 372 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  32.48 
 
 		 356 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  34.51 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  44.62 
 
 		 261 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 396 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  31.06 
 
 		 289 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 346 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  32.56 
 
 		 291 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  26.8 
 
 		 357 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  35 
 
 		 215 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  34.44 
 
 		 362 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  44.23 
 
 		 366 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1743  hypothetical protein  26.75 
 
 		 236 aa  44.3  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000786691  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  32.65 
 
 		 270 aa  44.3  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  28.19 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  36.9 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  48.08 
 
 		 401 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  36.9 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  36.17 
 
 		 404 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  36.9 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  32.52 
 
 		 289 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  37.74 
 
 		 267 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  36.78 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 349 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  30.94 
 
 		 286 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  42.86 
 
 		 336 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.621237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  27.12 
 
 		 400 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  32.99 
 
 		 416 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  36.84 
 
 		 386 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  32.35 
 
 		 307 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1825  hypothetical protein  30.48 
 
 		 448 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  34.07 
 
 		 351 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  34.78 
 
 		 283 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1835  hypothetical protein  32.58 
 
 		 286 aa  41.6  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0704752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  32 
 
 		 271 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  32 
 
 		 271 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  34.02 
 
 		 352 aa  41.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  24.7 
 
 		 294 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  29.46 
 
 		 294 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  28.85 
 
 		 227 aa  40.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>