More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0095 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 315 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  49.48 
 
 		 312 aa  279  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  32.99 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  32.69 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  36.24 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  34.38 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  35.12 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 315 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  34.04 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  32.52 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  31.48 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.56 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  31.47 
 
 		 364 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.22 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 364 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.8 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  30.22 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  30.73 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.19 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  36.24 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.71 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  32.22 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  30.6 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.4 
 
 		 438 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.66 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  25.78 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  27.01 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  27.55 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  27.65 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  25.68 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  26.32 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  23.33 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  22.48 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  24.38 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  24.67 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  27.52 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 611 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  23.83 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>