More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0028 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 237 aa  491  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.38 
 
 		 230 aa  228  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.21 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  51.07 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.66 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.36 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.07 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.22 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.07 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.78 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.64 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  54.01 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.01 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.03 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.8 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.49 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.38 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.13 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.02 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.99 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.81 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.7 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  45.3 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.08 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.64 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.11 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.76 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  44.4 
 
 		 236 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.74 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.23 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.17 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.29 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  55 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.49 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.84 
 
 		 238 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.99 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.08 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  55 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.06 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.03 
 
 		 239 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.9 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  47.03 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2256  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.61 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  45 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.7 
 
 		 267 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.86 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.67 
 
 		 243 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  46.31 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.53 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.3 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.98 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  46.64 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2183  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.12 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  46.64 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.39 
 
 		 243 aa  174  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  43.85 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1724  DNA polymerase III subunit epsilon  42.62 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.54 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.7 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.25 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3466  DNA polymerase III subunit epsilon  42.21 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4141  DNA polymerase III subunit epsilon  42.21 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  43.44 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  45.9 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  43.33 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.68 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.74 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  42.86 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  42.86 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  39.83 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.87 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  42.86 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  42.86 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  42.86 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  42.86 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  42.86 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.08 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  39.83 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02468  DNA polymerase III subunit epsilon  41.08 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.650155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  45.38 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.67 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.27 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  41.49 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3713  DNA polymerase III subunit epsilon  42.21 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  46.72 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.08 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  44.21 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.25 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1361  DNA polymerase III subunit epsilon  41.18 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.34 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2284  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.7 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1296  DNA polymerase III subunit epsilon  41.77 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  41.74 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  40.56 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  48.19 
 
 		 252 aa  167  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  41.39 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  41.39 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.56 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  43.39 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>