291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0033 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  98.5 
 
 
334 aa  662  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  98.2 
 
 
334 aa  659  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 
334 aa  669  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  88.02 
 
 
334 aa  604  1e-172  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  73.05 
 
 
333 aa  513  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  50.45 
 
 
337 aa  340  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  2.33811e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  50.15 
 
 
337 aa  333  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  49.55 
 
 
333 aa  331  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  48.66 
 
 
337 aa  328  5e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  49.39 
 
 
335 aa  324  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  47.46 
 
 
337 aa  322  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  48.65 
 
 
337 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 
338 aa  302  6e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  47.65 
 
 
340 aa  298  6e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  1.86989e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  47.46 
 
 
337 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 
338 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  49.27 
 
 
342 aa  296  4e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  48.1 
 
 
338 aa  293  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  48.73 
 
 
338 aa  289  4e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  45.4 
 
 
338 aa  288  7e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  44.67 
 
 
339 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 
338 aa  283  3e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  45.43 
 
 
340 aa  282  7e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  46.83 
 
 
334 aa  273  2e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  40 
 
 
331 aa  247  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  40.35 
 
 
347 aa  240  3e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  38.79 
 
 
341 aa  234  2e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  4.32349e-07  hitchhiker  6.58147e-06 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  39.38 
 
 
351 aa  228  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  36.61 
 
 
390 aa  222  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  37.78 
 
 
389 aa  216  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  4.73174e-05 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.87 
 
 
386 aa  213  3e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  35.62 
 
 
392 aa  212  8e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  32.87 
 
 
389 aa  184  2e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  33.14 
 
 
206 aa  72.8  8e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  32.68 
 
 
272 aa  69.7  7e-11  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  31.88 
 
 
211 aa  69.3  9e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.8  2e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.46604e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.8  2e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.05997e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.8  2e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.41135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.8  2e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.51418e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.8  2e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.86131e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.8  2e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.67077e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.8  2e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.68091e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.8  2e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.4  3e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.42867e-10  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  36.43 
 
 
210 aa  67.4  3e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.75669e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  33.85 
 
 
211 aa  67.4  4e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 
220 aa  67.4  4e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  35.66 
 
 
210 aa  67  4e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.19433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  36.67 
 
 
213 aa  65.5  1e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  35.97 
 
 
212 aa  65.9  1e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.99127e-06  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  34.62 
 
 
211 aa  65.5  1e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  30.29 
 
 
210 aa  64.3  3e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  36.22 
 
 
209 aa  63.9  3e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  34.11 
 
 
208 aa  63.2  6e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.2853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  29.61 
 
 
206 aa  63.2  7e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  34.84 
 
 
210 aa  62.8  8e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  31.62 
 
 
213 aa  62  1e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  34.38 
 
 
209 aa  61.2  2e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.31855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  32.03 
 
 
212 aa  62  2e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  27.5 
 
 
218 aa  61.2  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  31.54 
 
 
218 aa  61.2  2e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  39.18 
 
 
212 aa  60.8  3e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  5.25785e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  33.58 
 
 
208 aa  60.8  3e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  33.59 
 
 
209 aa  60.8  3e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.24684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  28.3 
 
 
217 aa  60.8  3e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 
209 aa  60.8  3e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  32.65 
 
 
218 aa  60.5  4e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  26.58 
 
 
219 aa  60.5  4e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  32.85 
 
 
219 aa  60.1  5e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  34.38 
 
 
212 aa  60.1  6e-08  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  8.08775e-12  hitchhiker  3.19768e-05 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  31.88 
 
 
220 aa  59.7  7e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.23614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  31.01 
 
 
216 aa  59.7  7e-08  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0767  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 
208 aa  59.7  7e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  29.06 
 
 
205 aa  59.3  8e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  30.05 
 
 
205 aa  59.3  8e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  36.8 
 
 
211 aa  59.3  9e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  6.45255e-07 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  31.25 
 
 
216 aa  58.9  1e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  3.85888e-10  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  32.45 
 
 
243 aa  58.9  1e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  27.37 
 
 
257 aa  58.9  1e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  34.53 
 
 
212 aa  58.5  1e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  1.09318e-13  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  27.65 
 
 
238 aa  58.9  1e-07  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.49955e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  31.54 
 
 
205 aa  59.3  1e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  5.30687e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  27.56 
 
 
219 aa  58.9  1e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  28.12 
 
 
217 aa  58.2  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  32.64 
 
 
223 aa  58.2  2e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  28.12 
 
 
217 aa  58.2  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0394  50S ribosomal protein L3  36.96 
 
 
216 aa  58.2  2e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  28.12 
 
 
217 aa  58.2  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  32.05 
 
 
212 aa  58.5  2e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  29.6 
 
 
216 aa  57.8  2e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  36.28 
 
 
210 aa  58.2  2e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  32.19 
 
 
228 aa  58.2  2e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0369  50S ribosomal protein L3  36.96 
 
 
216 aa  57.8  2e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  32.03 
 
 
214 aa  57.8  3e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  6.58885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  31.16 
 
 
220 aa  57.8  3e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  28.57 
 
 
251 aa  57.4  3e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  36.29 
 
 
205 aa  57.4  4e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  26.61 
 
 
216 aa  57  4e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  29.69 
 
 
214 aa  56.6  6e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>