More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0435 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  70.6 
 
 		 535 aa  765    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  73.67 
 
 		 540 aa  808    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  74.39 
 
 		 535 aa  817    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  68.7 
 
 		 548 aa  753    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 544 aa  1107    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  68.89 
 
 		 548 aa  754    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  68.7 
 
 		 548 aa  753    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  89.34 
 
 		 544 aa  992    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  70.52 
 
 		 530 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  54.08 
 
 		 550 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  46.92 
 
 		 532 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  46.88 
 
 		 541 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  42.41 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  41.46 
 
 		 546 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  42.57 
 
 		 539 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  43.37 
 
 		 560 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  41.92 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  42.08 
 
 		 569 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  41.88 
 
 		 564 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  42.03 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 		 545 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  43.33 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  42.43 
 
 		 574 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  42.71 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  42.71 
 
 		 577 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  39.86 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  40.49 
 
 		 544 aa  360  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 560 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  38.17 
 
 		 531 aa  309  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 518 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.82 
 
 		 500 aa  233  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  31.32 
 
 		 492 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.12 
 
 		 499 aa  230  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  31.76 
 
 		 531 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 536 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 510 aa  228  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  32.88 
 
 		 532 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 552 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.39 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 516 aa  223  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.82 
 
 		 543 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.45 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.45 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.93 
 
 		 509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  30.88 
 
 		 515 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 526 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  30.88 
 
 		 515 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 546 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.06 
 
 		 565 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  30.5 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 515 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  31.03 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.07 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.03 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  34.77 
 
 		 487 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  30.48 
 
 		 515 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 		 514 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 518 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 		 523 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  27.7 
 
 		 596 aa  204  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.17 
 
 		 555 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 523 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 662 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 505 aa  203  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.82 
 
 		 516 aa  203  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 521 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.71 
 
 		 512 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 512 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  30.32 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  26.48 
 
 		 544 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 553 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  30.32 
 
 		 510 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.34 
 
 		 498 aa  200  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 492 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 519 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 520 aa  199  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 499 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  28.85 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.25 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  29.75 
 
 		 570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 514 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  29.39 
 
 		 576 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.74 
 
 		 525 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>