More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2341 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
128 aa  255  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.38 
 
 
138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0726  protein TolR  49.21 
 
 
144 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.784758  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0682  protein TolR  49.21 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794848  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  46.38 
 
 
149 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  45.65 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  45.65 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  45.65 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  45.65 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.06 
 
 
139 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  45.65 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  45.65 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  45.65 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0733  putative TOLR-related transport transmembrane protein  49.21 
 
 
144 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.670063 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.04 
 
 
139 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2208  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.51 
 
 
136 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  44.93 
 
 
149 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  44.93 
 
 
149 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 
149 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 
149 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  44.93 
 
 
149 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 
149 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 
149 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4795  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.91 
 
 
140 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  normal  0.0719487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  47.15 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.42 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.88 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.31 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2453  protein TolR  44.96 
 
 
148 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.94 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.94 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.64 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  42.64 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.01 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  40.94 
 
 
142 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.44 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  43.44 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  43.44 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
141 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  42.62 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  43.09 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2942  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.05 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.4 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.28 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.55 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.64 
 
 
142 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  39.42 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.18 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.61 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.71 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  42.42 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2462  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0870388  normal  0.859311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  36.72 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  38.24 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  39.84 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  38.28 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  38.46 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.22 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  39.55 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.97 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  37.82 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  37.41 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  40 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  37.68 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.94 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  36.36 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  36.36 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  38.66 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  39.29 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  39.29 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  39.13 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  38.81 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.57 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238629  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  35.24 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  36.97 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  38.58 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  36.97 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  36.97 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  40.44 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  40.44 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  37.82 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  37.82 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  36.97 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  36.13 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  36.97 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  36.97 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  36.97 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>