More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1345 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  100 
 
 
455 aa  919    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.51 
 
 
446 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.9 
 
 
445 aa  300  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.74 
 
 
449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.33 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  34.27 
 
 
451 aa  216  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  30.89 
 
 
440 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.99 
 
 
449 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 
456 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  33.64 
 
 
454 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  31.65 
 
 
443 aa  206  9e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.24 
 
 
497 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.08 
 
 
450 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  30.25 
 
 
493 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  30.59 
 
 
455 aa  203  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.48 
 
 
451 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  31.06 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.22 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  32.31 
 
 
477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.25 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  32.85 
 
 
481 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  30.37 
 
 
455 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.46 
 
 
442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.38 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.46 
 
 
456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.65 
 
 
477 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.5 
 
 
455 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.95 
 
 
461 aa  196  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.52 
 
 
480 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.63 
 
 
512 aa  194  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.43 
 
 
477 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  31.26 
 
 
443 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20050  putative outer membrane protein  32.39 
 
 
451 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.7908  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  29 
 
 
459 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.77 
 
 
466 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.17 
 
 
436 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.2 
 
 
477 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  29.8 
 
 
482 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.07 
 
 
441 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.14 
 
 
446 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.86 
 
 
489 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  31.88 
 
 
441 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1726  secretion protein  31.92 
 
 
451 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.43 
 
 
477 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.2 
 
 
451 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.67 
 
 
478 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  30.65 
 
 
481 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.99 
 
 
453 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.59 
 
 
478 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.66 
 
 
480 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.23 
 
 
488 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.29 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.24 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  30.91 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.87 
 
 
452 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  30.96 
 
 
435 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  30.96 
 
 
435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.93 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.64 
 
 
491 aa  183  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  29.29 
 
 
438 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.98 
 
 
434 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  30.57 
 
 
435 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.79 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.26 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  30.91 
 
 
435 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  29.96 
 
 
462 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  31.11 
 
 
437 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.49 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.86 
 
 
443 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  29.78 
 
 
479 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  30.07 
 
 
435 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  30.07 
 
 
435 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  30.07 
 
 
435 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  29.71 
 
 
434 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  29.83 
 
 
435 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  26.46 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  28.18 
 
 
441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.79 
 
 
469 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  29.67 
 
 
431 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  30.43 
 
 
448 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.08 
 
 
464 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  29.93 
 
 
432 aa  171  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28 
 
 
456 aa  170  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.26 
 
 
446 aa  170  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  29.3 
 
 
445 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  28.97 
 
 
442 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  30.28 
 
 
452 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.05 
 
 
539 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  28.74 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.05 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.48 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.48 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.94 
 
 
481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.68 
 
 
489 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1277  outer membrane protein TolC, putative  29.65 
 
 
479 aa  161  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  27.03 
 
 
494 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  27.92 
 
 
432 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.91 
 
 
491 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.77 
 
 
447 aa  156  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>