More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2699 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  77.57 
 
 		 538 aa  823    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  71.83 
 
 		 537 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  74.36 
 
 		 537 aa  763    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  74.36 
 
 		 537 aa  763    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  72.41 
 
 		 533 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  73.11 
 
 		 538 aa  779    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  63.83 
 
 		 535 aa  653    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  94.39 
 
 		 545 aa  972    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  89.25 
 
 		 544 aa  931    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  72.21 
 
 		 552 aa  749    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  75.73 
 
 		 539 aa  777    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  76.12 
 
 		 537 aa  790    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  74.27 
 
 		 541 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  94.64 
 
 		 560 aa  1041    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  73.03 
 
 		 540 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  73.97 
 
 		 535 aa  761    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  74.61 
 
 		 536 aa  785    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  63.25 
 
 		 538 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  74.36 
 
 		 536 aa  758    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  63.83 
 
 		 535 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  64.48 
 
 		 568 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  72.99 
 
 		 534 aa  748    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  100 
 
 		 545 aa  1074    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  63.64 
 
 		 534 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  68.79 
 
 		 572 aa  714    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  72.99 
 
 		 535 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  79.06 
 
 		 532 aa  842    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  87.27 
 
 		 536 aa  937    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  63.65 
 
 		 544 aa  653    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  71.82 
 
 		 538 aa  743    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  67.51 
 
 		 537 aa  704    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  99.63 
 
 		 545 aa  1071    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  76.7 
 
 		 531 aa  809    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  60.5 
 
 		 559 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  62.92 
 
 		 516 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  61.33 
 
 		 544 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  57.32 
 
 		 590 aa  607  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  59.85 
 
 		 548 aa  594  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  63.19 
 
 		 506 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  61.95 
 
 		 529 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  64.89 
 
 		 523 aa  578  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  54.19 
 
 		 506 aa  509  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 517 aa  428  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  46.03 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  46.96 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  46.96 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03397  transcription elongation factor NusA  46.14 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  47.84 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  42.67 
 
 		 517 aa  418  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002608  transcription termination protein NusA  46.14 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000346209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  44.01 
 
 		 493 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0173  transcription elongation factor NusA  44.26 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000303519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  46.85 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  46.19 
 
 		 493 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  46.2 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  44.01 
 
 		 493 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  46.56 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03036  transcription elongation factor NusA  44.6 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0536  NusA antitermination factor  44.6 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3653  transcription elongation factor NusA  44.6 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.588616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  46.84 
 
 		 493 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  46.7 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  44.9 
 
 		 492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02987  hypothetical protein  44.6 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  44.71 
 
 		 495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0816  NusA antitermination factor  44.14 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.706967  hitchhiker  0.00205757 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0529  transcription elongation factor NusA  44.6 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000129927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3465  transcription elongation factor NusA  44.8 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246943  normal  0.841765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4490  transcription elongation factor NusA  44.6 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3361  transcription elongation factor NusA  44.6 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0352386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  46.62 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  43.33 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  44.75 
 
 		 503 aa  405  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3602  transcription elongation factor NusA  44.4 
 
 		 495 aa  405  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.761318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  46.27 
 
 		 491 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  46.62 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  44.47 
 
 		 491 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  46.62 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4713  transcription elongation factor NusA  46.41 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  46.19 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4491  N utilization substance protein A  45.97 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.119546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  45.97 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3545  transcription elongation factor NusA  43.81 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3644  transcription elongation factor NusA  43.81 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3582  transcription elongation factor NusA  43.81 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  45.22 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1094  transcription elongation factor NusA  45.13 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  43.43 
 
 		 491 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3476  transcription elongation factor NusA  43.81 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3477  transcription elongation factor NusA  43.61 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2750  NusA antitermination factor  44.25 
 
 		 494 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504995  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1288  transcription elongation factor NusA  44.04 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2835  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3606  transcription elongation factor NusA  43.65 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0209266  normal  0.0368341 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  46.09 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  46.03 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1025  transcription elongation factor NusA  44.33 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00167997  hitchhiker  0.00000356504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1090  transcription elongation factor NusA  44.33 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136267  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1029  transcription elongation factor NusA  44.33 
 
 		 499 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0307152  hitchhiker  0.0000658902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3384  NusA antitermination factor  44.66 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0163394  normal  0.419703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>