More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1108 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  79.13 
 
 
395 aa  661    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  78.88 
 
 
395 aa  662    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
395 aa  804    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  80.15 
 
 
395 aa  667    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
383 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  45.57 
 
 
401 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  44.02 
 
 
397 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
397 aa  363  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  44.86 
 
 
406 aa  361  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  45.94 
 
 
400 aa  359  4e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  43.81 
 
 
393 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  41.75 
 
 
397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  43.44 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  43.56 
 
 
393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  46.06 
 
 
396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  42.16 
 
 
417 aa  352  8.999999999999999e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
393 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  43.96 
 
 
393 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  43.96 
 
 
393 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
398 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 
393 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  43.19 
 
 
393 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  42.01 
 
 
398 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
393 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  42.01 
 
 
398 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  43.7 
 
 
393 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  43.7 
 
 
393 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  44.27 
 
 
397 aa  344  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  43.7 
 
 
393 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  43.7 
 
 
393 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  43.7 
 
 
393 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  43.7 
 
 
393 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  41.33 
 
 
404 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  41.97 
 
 
396 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  41.97 
 
 
396 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
405 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  42.12 
 
 
406 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  41.97 
 
 
400 aa  330  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 
394 aa  329  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.31 
 
 
394 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 
411 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
340 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.78 
 
 
436 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  40.95 
 
 
411 aa  316  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
393 aa  315  8e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
403 aa  313  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 
611 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 
394 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 
463 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  40.25 
 
 
405 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  39.55 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  40.65 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
401 aa  306  6e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  39.95 
 
 
410 aa  305  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  39.95 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 
436 aa  303  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
399 aa  303  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 
438 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.93 
 
 
399 aa  301  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
410 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
411 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.4 
 
 
446 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 
401 aa  300  4e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.8 
 
 
377 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  38.07 
 
 
406 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
407 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  38.72 
 
 
386 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
399 aa  297  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.61 
 
 
437 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  35.81 
 
 
439 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
398 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  37.72 
 
 
404 aa  295  6e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
395 aa  295  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
399 aa  295  8e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38.13 
 
 
402 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 
426 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 
416 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
437 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
416 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 
446 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  36.83 
 
 
454 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 
440 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
441 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38.13 
 
 
402 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  35.97 
 
 
433 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
413 aa  292  7e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 
395 aa  292  7e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
426 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 
414 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  36.79 
 
 
420 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  38.37 
 
 
411 aa  289  7e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  37.84 
 
 
397 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.49 
 
 
404 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 
438 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>