More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1265 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.35 
 
 		 732 aa  694    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  53.41 
 
 		 768 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.65 
 
 		 631 aa  746    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.62 
 
 		 732 aa  659    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  50.63 
 
 		 712 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  53.5 
 
 		 736 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  47.36 
 
 		 754 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  55.91 
 
 		 740 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.53 
 
 		 659 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  52.71 
 
 		 731 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  54.33 
 
 		 766 aa  729    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  53.62 
 
 		 755 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.19 
 
 		 741 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  53.75 
 
 		 732 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  51.94 
 
 		 736 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  51.81 
 
 		 712 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.06 
 
 		 785 aa  666    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  53.19 
 
 		 741 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  53.5 
 
 		 736 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  53.29 
 
 		 749 aa  653    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  48.76 
 
 		 755 aa  659    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  52.71 
 
 		 750 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  49.3 
 
 		 756 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  52.88 
 
 		 740 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  52.19 
 
 		 716 aa  664    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  52.25 
 
 		 738 aa  661    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  47.36 
 
 		 754 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  54.33 
 
 		 764 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  52.09 
 
 		 738 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  54.33 
 
 		 749 aa  697    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.75 
 
 		 730 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  52.8 
 
 		 743 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  54.43 
 
 		 748 aa  669    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  55.98 
 
 		 728 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  52.56 
 
 		 735 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  51.55 
 
 		 764 aa  676    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  50.85 
 
 		 765 aa  673    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.21 
 
 		 735 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  52.17 
 
 		 726 aa  682    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  53.65 
 
 		 736 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  47.52 
 
 		 754 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  55.8 
 
 		 774 aa  736    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  52 
 
 		 746 aa  641    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  56.14 
 
 		 728 aa  703    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  48.76 
 
 		 755 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  53.61 
 
 		 740 aa  704    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  55.04 
 
 		 834 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  53.89 
 
 		 736 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  52.86 
 
 		 812 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  52.36 
 
 		 716 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.55 
 
 		 739 aa  646    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  51.86 
 
 		 733 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  58.97 
 
 		 625 aa  738    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  51.18 
 
 		 729 aa  669    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  47.52 
 
 		 754 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  53.29 
 
 		 716 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  52.32 
 
 		 782 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  51.4 
 
 		 736 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  52.2 
 
 		 716 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.25 
 
 		 729 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  52.49 
 
 		 716 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  54.29 
 
 		 727 aa  682    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  51.24 
 
 		 736 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  51.55 
 
 		 736 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  56.09 
 
 		 722 aa  721    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 		 638 aa  642    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  51.79 
 
 		 741 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.94 
 
 		 626 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  53.76 
 
 		 738 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  54.62 
 
 		 728 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  52.85 
 
 		 737 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  63.16 
 
 		 1217 aa  787    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  50.7 
 
 		 750 aa  646    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  52.2 
 
 		 716 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  52.32 
 
 		 776 aa  696    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.18 
 
 		 784 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.51 
 
 		 728 aa  716    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  54.72 
 
 		 695 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  50.31 
 
 		 759 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  52.17 
 
 		 733 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  54.06 
 
 		 732 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  52.69 
 
 		 725 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  51.35 
 
 		 1224 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  51.24 
 
 		 736 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  52.09 
 
 		 738 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.5 
 
 		 737 aa  723    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  65.93 
 
 		 642 aa  863    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  52.54 
 
 		 723 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  54.75 
 
 		 728 aa  673    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  52.09 
 
 		 732 aa  664    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  51.99 
 
 		 727 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 642 aa  1321    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  49.29 
 
 		 731 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.06 
 
 		 770 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.85 
 
 		 760 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.32 
 
 		 728 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  58.95 
 
 		 634 aa  783    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  54.33 
 
 		 763 aa  731    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.23 
 
 		 631 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  54.05 
 
 		 640 aa  658    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>