More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0069 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  100 
 
 		 433 aa  853    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  58.96 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  48.33 
 
 		 441 aa  345  6e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  36.28 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  34.36 
 
 		 429 aa  210  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  32.36 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  35.81 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  35.73 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  35.73 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  35.73 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  35.73 
 
 		 430 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  35.73 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  35.73 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  35.73 
 
 		 430 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  35.73 
 
 		 430 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  41.24 
 
 		 279 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  31.12 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  30.55 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  30.83 
 
 		 441 aa  155  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  31.03 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  33.44 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  31.4 
 
 		 786 aa  136  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 		 770 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  31.17 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  28.38 
 
 		 753 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 745 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 475 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 764 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  32.43 
 
 		 764 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 792 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 812 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 716 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 796 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  26.76 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  28.47 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 510 aa  100  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 439 aa  99.8  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 773 aa  99.8  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 486 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 538 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 820 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  30.33 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.95 
 
 		 476 aa  97.4  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1457  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  29.52 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0681  amino acid permease-associated region  34.08 
 
 		 195 aa  94.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  26.63 
 
 		 426 aa  93.6  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 471 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  25.33 
 
 		 471 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.34 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.73 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  24.46 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.73 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 740 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 725 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 490 aa  89.7  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 518 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 		 495 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  26.35 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 488 aa  87.8  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 478 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  25.87 
 
 		 471 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 452 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1733  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  24.74 
 
 		 543 aa  86.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  26.19 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  22.74 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>