More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2734 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  100 
 
 		 347 aa  681    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  56.27 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  45.8 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  47.13 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  44.93 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  45.57 
 
 		 352 aa  295  7e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  48.39 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  44.31 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  45.09 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  42.65 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  42.82 
 
 		 371 aa  282  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  45.7 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  45.4 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  45.4 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  43.41 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  45.4 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  43.73 
 
 		 360 aa  275  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  45.25 
 
 		 331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  48.24 
 
 		 352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  45.43 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  44.44 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  42.99 
 
 		 360 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  45.13 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  44.81 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  43.23 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  43.62 
 
 		 359 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  43.32 
 
 		 359 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  43.32 
 
 		 359 aa  261  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  43.03 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  41.71 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  44.67 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  43.03 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  37.32 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  42.26 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  39.83 
 
 		 350 aa  249  7e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.62 
 
 		 373 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  42.47 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  41.4 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  42.22 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  37.36 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  39.94 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  38.57 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  40.13 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  46.41 
 
 		 350 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  39.49 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  39.06 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  38.76 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  42.2 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  37.57 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  41.64 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  36.92 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  43.31 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  38.91 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  40.54 
 
 		 355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  36.84 
 
 		 375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  41.98 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  38.75 
 
 		 301 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  38.07 
 
 		 362 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  35.34 
 
 		 348 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  35.82 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  39.76 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  37.78 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  36.97 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  40.2 
 
 		 349 aa  206  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 356 aa  205  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  36.89 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.93 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  37.58 
 
 		 357 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  36.93 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  36.93 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  37.5 
 
 		 381 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  35.96 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  36.26 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  37.1 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  37.58 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.79 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  33.65 
 
 		 347 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  33.23 
 
 		 350 aa  190  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  37.01 
 
 		 344 aa  189  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  35.63 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  40.13 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.43 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  36.64 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  33.14 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  32.95 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  34.38 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.13 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  33.63 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  37.28 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  37.28 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  36.05 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  36.76 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  35.97 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  36.05 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  38.74 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>