More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1201 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  62.29 
 
 		 551 aa  670    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  68.12 
 
 		 552 aa  708    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  67.68 
 
 		 543 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  100 
 
 		 555 aa  1110    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  69.26 
 
 		 551 aa  729    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  67.56 
 
 		 552 aa  705    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  63.64 
 
 		 500 aa  637    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  75.91 
 
 		 542 aa  833    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  63.34 
 
 		 539 aa  669    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  62.43 
 
 		 547 aa  651    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  68.05 
 
 		 553 aa  713    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  68.77 
 
 		 543 aa  744    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  62.96 
 
 		 560 aa  669    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  67.68 
 
 		 551 aa  714    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  60.47 
 
 		 542 aa  633  1e-180  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  60.47 
 
 		 545 aa  634  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  59.81 
 
 		 563 aa  634  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  60.27 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  60.23 
 
 		 543 aa  629  1e-179  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  59.23 
 
 		 559 aa  630  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  59.92 
 
 		 543 aa  629  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  58.85 
 
 		 558 aa  619  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  56.53 
 
 		 557 aa  619  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  54.7 
 
 		 570 aa  585  1e-166  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  55.56 
 
 		 553 aa  579  1e-164  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  54.93 
 
 		 545 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  53.21 
 
 		 554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  57.34 
 
 		 558 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  51.74 
 
 		 540 aa  556  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  52.66 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  51.92 
 
 		 553 aa  546  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  51.35 
 
 		 554 aa  547  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  50.09 
 
 		 559 aa  542  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.68 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.31 
 
 		 530 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  53.75 
 
 		 541 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  51.63 
 
 		 552 aa  538  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  51.11 
 
 		 562 aa  531  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  51.13 
 
 		 561 aa  527  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.42 
 
 		 527 aa  527  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  51.15 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  51.35 
 
 		 558 aa  520  1e-146  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  51.84 
 
 		 554 aa  519  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  51.45 
 
 		 560 aa  519  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.87 
 
 		 536 aa  514  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  49.15 
 
 		 558 aa  512  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  51.72 
 
 		 554 aa  512  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  51.43 
 
 		 549 aa  509  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  50.39 
 
 		 553 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  51.15 
 
 		 550 aa  503  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  47.98 
 
 		 547 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  49.42 
 
 		 548 aa  499  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.92 
 
 		 532 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.43 
 
 		 555 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.54 
 
 		 537 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.93 
 
 		 519 aa  458  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.74 
 
 		 525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.95 
 
 		 525 aa  442  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.52 
 
 		 528 aa  442  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.3 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  46.64 
 
 		 528 aa  444  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  40.7 
 
 		 535 aa  398  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  41.63 
 
 		 527 aa  398  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  38.65 
 
 		 538 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  41.73 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  37.17 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  40.89 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  37.43 
 
 		 527 aa  375  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  36.25 
 
 		 559 aa  369  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  38.15 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  38.15 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  37.15 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  38.7 
 
 		 536 aa  364  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  38.51 
 
 		 542 aa  360  5e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  39.62 
 
 		 541 aa  359  6e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  39.02 
 
 		 550 aa  357  2.9999999999999997e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  39.04 
 
 		 533 aa  353  2.9999999999999997e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  36.52 
 
 		 570 aa  351  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  37.71 
 
 		 548 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  39.77 
 
 		 536 aa  350  4e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  38.05 
 
 		 542 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  36.43 
 
 		 553 aa  345  8.999999999999999e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  38.5 
 
 		 551 aa  344  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  36.81 
 
 		 577 aa  343  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  35.92 
 
 		 563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  38.59 
 
 		 548 aa  336  5.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  34.54 
 
 		 558 aa  332  8e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  33.77 
 
 		 568 aa  322  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.82 
 
 		 530 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  34.71 
 
 		 523 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.35 
 
 		 531 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  34.79 
 
 		 552 aa  301  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  32.75 
 
 		 558 aa  292  9e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  36.27 
 
 		 526 aa  291  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  35.08 
 
 		 527 aa  285  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  31.97 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  33.14 
 
 		 534 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  33.14 
 
 		 534 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  31.43 
 
 		 547 aa  272  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.02 
 
 		 539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>