203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1349 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 392 aa  785    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  57.4 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  58.1 
 
 		 385 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  56.62 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  55.36 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  32.23 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  30.08 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  28.35 
 
 		 416 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  30.81 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  32.8 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  31.35 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  33.61 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  31.08 
 
 		 390 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.7 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.67 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  29.82 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  26.6 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  26.56 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  24.02 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  23.27 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  24.64 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 		 362 aa  96.7  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  22.37 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 381 aa  89.7  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.34 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  24.67 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 		 399 aa  86.3  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  25.07 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  22.8 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.1 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  24.52 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.56 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  20.98 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  21.26 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  22.47 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  20.37 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  20.73 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  22.13 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.08 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  20.99 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  19.79 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  22.02 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.34 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 407 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.82 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  22.12 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  22.28 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  20.84 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  25.88 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  21.07 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  21.05 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  20.35 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.08 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  21.88 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  21.88 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  22.89 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  20.47 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  21.79 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  22.67 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  22.07 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.44 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.34 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  21.43 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  23.92 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  20.58 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.65 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  20.45 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  21.33 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  20.63 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  21.47 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  23.22 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  22.83 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  21.59 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>