More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1307 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
391 aa  789  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  69.25 
 
 
390 aa  572  1e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  67.77 
 
 
390 aa  558  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  69.57 
 
 
390 aa  552  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  69.57 
 
 
390 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  40.69 
 
 
406 aa  276  7e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  38.52 
 
 
408 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  39.85 
 
 
395 aa  249  5e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  38.24 
 
 
391 aa  246  5e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  39.25 
 
 
407 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 
399 aa  229  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  36.92 
 
 
397 aa  224  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  36.83 
 
 
398 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  33.7 
 
 
399 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  37.74 
 
 
402 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  34.68 
 
 
398 aa  199  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  35 
 
 
396 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  31.96 
 
 
386 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  32.44 
 
 
387 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  31.15 
 
 
386 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 
385 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  33.61 
 
 
392 aa  166  8e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  31.78 
 
 
392 aa  165  1e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 
396 aa  163  4e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  32.1 
 
 
416 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  31.36 
 
 
391 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  30.53 
 
 
365 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  29.95 
 
 
396 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.99674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  34.31 
 
 
402 aa  145  8e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  27.56 
 
 
385 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.95 
 
 
375 aa  135  1e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  31.1 
 
 
363 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 
341 aa  129  1e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.08 
 
 
360 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 
381 aa  123  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 
385 aa  122  1e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  29.41 
 
 
378 aa  119  1e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 
348 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.47 
 
 
379 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 
384 aa  112  8e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.41 
 
 
382 aa  111  2e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 
376 aa  111  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 
379 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 
376 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 
453 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 
421 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 
382 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 
380 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25.95 
 
 
379 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 
413 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 
375 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 
425 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 
389 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.11 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  30.28 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  30.28 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  7.12182e-10 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.7 
 
 
384 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 
380 aa  96.7  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  26 
 
 
368 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 
393 aa  94  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  24.29 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.58 
 
 
446 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
410 aa  93.2  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.9 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  23.36 
 
 
380 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 
406 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 
434 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.4 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.58 
 
 
446 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  26.68 
 
 
418 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 
455 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 
457 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.05 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 
424 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 
393 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 
385 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 
423 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 
398 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
370 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
452 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 
405 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 
423 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  6.08264e-05  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 
452 aa  86.7  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>