More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2048 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  67.89 
 
 		 1047 aa  1487    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  67.98 
 
 		 1047 aa  1488    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  51.74 
 
 		 1061 aa  1065    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  47.61 
 
 		 1045 aa  998    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  57.83 
 
 		 1048 aa  1253    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  66.76 
 
 		 1048 aa  1478    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  55.99 
 
 		 1049 aa  1247    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  73.57 
 
 		 1052 aa  1565    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  68.42 
 
 		 1068 aa  1450    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  57.87 
 
 		 1042 aa  1275    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.13 
 
 		 1077 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  55.65 
 
 		 1066 aa  1174    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  35.69 
 
 		 1070 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  72.54 
 
 		 1047 aa  1533    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  56.36 
 
 		 1047 aa  1247    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  66.76 
 
 		 1048 aa  1478    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  46.77 
 
 		 1045 aa  988    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  58.1 
 
 		 1052 aa  1250    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  56.85 
 
 		 1039 aa  1211    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  56.27 
 
 		 1045 aa  1239    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  56.11 
 
 		 1045 aa  1228    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.49 
 
 		 1053 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  68.11 
 
 		 1070 aa  1437    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.03 
 
 		 1077 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  46.72 
 
 		 1047 aa  989    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  35.29 
 
 		 1049 aa  658    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.2 
 
 		 1052 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.82 
 
 		 1054 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  56.09 
 
 		 1045 aa  1235    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  58.56 
 
 		 1056 aa  1252    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  46.72 
 
 		 1046 aa  967    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  54.72 
 
 		 1051 aa  1165    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  56.28 
 
 		 1044 aa  1184    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  72.96 
 
 		 1055 aa  1567    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.13 
 
 		 1077 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.53 
 
 		 1059 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  76.03 
 
 		 1060 aa  1631    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  54.63 
 
 		 1043 aa  1160    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  55.42 
 
 		 1058 aa  1134    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  68.05 
 
 		 1070 aa  1434    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.31 
 
 		 1077 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  45.83 
 
 		 1091 aa  946    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.31 
 
 		 1077 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.13 
 
 		 1077 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  53.8 
 
 		 1067 aa  1130    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  47.62 
 
 		 1074 aa  989    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  75.98 
 
 		 1056 aa  1640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.2 
 
 		 1050 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  52.19 
 
 		 1074 aa  1140    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.31 
 
 		 1070 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  46.58 
 
 		 1045 aa  1006    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  63.44 
 
 		 1038 aa  1387    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.11 
 
 		 1070 aa  1437    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  55.55 
 
 		 1054 aa  1177    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.11 
 
 		 1070 aa  1437    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  41.72 
 
 		 1049 aa  887    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  41.25 
 
 		 1015 aa  835    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  59.2 
 
 		 1040 aa  1271    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  51.87 
 
 		 1059 aa  1112    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  54.78 
 
 		 1047 aa  1227    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  56.51 
 
 		 1049 aa  1252    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.69 
 
 		 1077 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  45.66 
 
 		 1094 aa  954    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  55.99 
 
 		 1051 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  45.95 
 
 		 1100 aa  931    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  53.79 
 
 		 1043 aa  1166    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  59.03 
 
 		 1039 aa  1289    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  47.1 
 
 		 1048 aa  1009    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  36.47 
 
 		 1054 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  58.07 
 
 		 1042 aa  1237    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  56.09 
 
 		 1052 aa  1170    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  82.99 
 
 		 1039 aa  1790    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  56.51 
 
 		 1049 aa  1251    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.11 
 
 		 1070 aa  1438    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  72.86 
 
 		 1056 aa  1560    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  74.51 
 
 		 1049 aa  1598    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  55.42 
 
 		 1042 aa  1229    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.11 
 
 		 1070 aa  1437    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  55.75 
 
 		 1043 aa  1154    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  54.77 
 
 		 1059 aa  1165    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  72.53 
 
 		 1063 aa  1565    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  56.18 
 
 		 1045 aa  1248    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  55.39 
 
 		 1060 aa  1148    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  54.77 
 
 		 1065 aa  1151    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.31 
 
 		 1077 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  38.13 
 
 		 1061 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  56.03 
 
 		 1060 aa  1160    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  68.17 
 
 		 1068 aa  1453    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  55.47 
 
 		 1069 aa  1171    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  72.55 
 
 		 1056 aa  1545    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  56.23 
 
 		 1045 aa  1246    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.11 
 
 		 1070 aa  1437    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  71.6 
 
 		 1055 aa  1545    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  67.85 
 
 		 1044 aa  1456    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  69.35 
 
 		 1044 aa  1474    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  73.76 
 
 		 1047 aa  1588    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  56.17 
 
 		 1058 aa  1160    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  35.69 
 
 		 1070 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  68.42 
 
 		 1068 aa  1450    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  56.02 
 
 		 1045 aa  1194    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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