More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1995 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  64.53 
 
 		 221 aa  242  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  56.35 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  52.5 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  52.94 
 
 		 210 aa  210  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  49.74 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  53.06 
 
 		 196 aa  204  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  51.93 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  49.5 
 
 		 203 aa  201  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  52.97 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  53.44 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  51.67 
 
 		 187 aa  197  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  51.31 
 
 		 194 aa  197  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  51.96 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  51.74 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  51.74 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  51.74 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  52.43 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  47.87 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  51.74 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  51.89 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  51.55 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  54.55 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  53.98 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  53.25 
 
 		 231 aa  191  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  51.22 
 
 		 205 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  53.11 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  52.31 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  52.31 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  52.05 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  53.59 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  53.59 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  53.04 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  51.79 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  47 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  50.73 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  54.95 
 
 		 191 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  51.7 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  51.22 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  52.67 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  49.43 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  47.73 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  48.21 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  47.16 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  50.31 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  47.77 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  50.31 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  50.31 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  49.69 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  45 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  40.88 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  37.44 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.41 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  39.64 
 
 		 264 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  43.4 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  43.42 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  36.41 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  35.23 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.21 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  39.62 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  40.12 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  40.65 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  40.67 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  36.27 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  38.56 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  32.47 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  39.74 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  40.13 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  46.56 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  32.47 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  41.89 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  44.8 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  34.55 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_2687  SCO1/SenC family protein  60.98 
 
 		 84 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.121674  normal  1 
 
 
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NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  40.43 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
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NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  40.43 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  42.34 
 
 		 197 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
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NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  44.26 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  35.95 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
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