121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1485 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  100 
 
 		 392 aa  815    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  59.19 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  59.19 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  57.39 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  56.46 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  52.13 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  32.12 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  32.64 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  34.22 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  33 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  35.89 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  36.46 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  28.97 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  34.35 
 
 		 380 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  29.33 
 
 		 382 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  29.33 
 
 		 382 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  28.95 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  33.22 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  29.75 
 
 		 428 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  32.55 
 
 		 421 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  33.9 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  33.22 
 
 		 380 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  35.31 
 
 		 471 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  33.67 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  30.32 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  33.1 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  32.49 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  36.71 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  29.15 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  31.07 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  30.71 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  28.84 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  34.78 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  33.56 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  31.37 
 
 		 425 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  30.67 
 
 		 315 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  31.85 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  32.89 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  32.44 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  29.18 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  30.99 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  30.95 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  34.11 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  28.57 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  31.53 
 
 		 393 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  30.87 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  34.05 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  34.05 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  28.54 
 
 		 440 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  33 
 
 		 408 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  30.07 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  31.6 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  29.68 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  29.95 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  27.69 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  27.69 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  27.69 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  28.9 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  28.79 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  28.79 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  29.44 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.1 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  33.1 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  31.72 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  29.63 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  29.63 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  27.01 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  30.43 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  30.85 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  30.57 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  30.75 
 
 		 562 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  31.47 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  30.23 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  30.93 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  26.13 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  27.65 
 
 		 369 aa  119  6e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  26.57 
 
 		 382 aa  119  9e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  30.86 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  32.85 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  26.1 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  29.25 
 
 		 466 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  24.01 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  28.67 
 
 		 514 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  25.24 
 
 		 438 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  27.34 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  27.74 
 
 		 337 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  27.4 
 
 		 479 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  26.79 
 
 		 359 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  26.79 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  28.02 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  27.42 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  28.23 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  23.98 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  23.93 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  23.69 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  27.7 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  27.7 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  25.44 
 
 		 282 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>