More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0818 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 501 aa  1023    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  40.98 
 
 		 516 aa  398  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 490 aa  385  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  40.48 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  41.4 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  40.6 
 
 		 495 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 488 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  40.24 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 523 aa  347  3e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 		 460 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  29.89 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1548  ABC transporter related  40.71 
 
 		 305 aa  204  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  28.12 
 
 		 548 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  28.81 
 
 		 542 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  27.34 
 
 		 577 aa  183  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  28.02 
 
 		 542 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 		 548 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.07 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  27.12 
 
 		 542 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1547  ABC transporter related  52.17 
 
 		 183 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  28.25 
 
 		 543 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  26.76 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.11 
 
 		 529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  27.24 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  25.28 
 
 		 624 aa  156  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  25.62 
 
 		 540 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  25.5 
 
 		 627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  27.21 
 
 		 626 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0243  ABC transporter, ATP-binding protein  27.39 
 
 		 626 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.592514  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  27.12 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  27.39 
 
 		 626 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  26.11 
 
 		 709 aa  148  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1609  ABC transporter related  24.95 
 
 		 504 aa  148  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000030441  hitchhiker  0.000000000000475647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  24.36 
 
 		 639 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  27.26 
 
 		 626 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  25.65 
 
 		 688 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  26.37 
 
 		 650 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  24.82 
 
 		 659 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2171  ABC transporter, ATP-binding protein  24.13 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0650343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  27.21 
 
 		 626 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  22.91 
 
 		 623 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  27.21 
 
 		 626 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.64 
 
 		 559 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  25.33 
 
 		 632 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1648  ABC transporter related protein  24.27 
 
 		 594 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  27.39 
 
 		 626 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0262  ABC transporter, ATP-binding protein  27.34 
 
 		 626 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  26.53 
 
 		 534 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  27.21 
 
 		 628 aa  144  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.53 
 
 		 550 aa  144  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  25.82 
 
 		 535 aa  143  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  24.82 
 
 		 634 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  27.32 
 
 		 534 aa  143  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  24.86 
 
 		 530 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.68 
 
 		 563 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  26.7 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  22.73 
 
 		 620 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1995  ABC transporter ATPase  23.84 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79953  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  24.82 
 
 		 645 aa  141  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  25.27 
 
 		 640 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  25.41 
 
 		 630 aa  141  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  25.84 
 
 		 555 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  29.23 
 
 		 541 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  25.84 
 
 		 564 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.86 
 
 		 559 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  25.31 
 
 		 544 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  23.5 
 
 		 621 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  24.41 
 
 		 558 aa  140  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.64 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  25.71 
 
 		 636 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  24.67 
 
 		 635 aa  140  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  24.42 
 
 		 639 aa  140  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1013  ABC transporter ATP-binding protein  25.09 
 
 		 522 aa  140  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  24.49 
 
 		 527 aa  140  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.38 
 
 		 555 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  21.67 
 
 		 612 aa  140  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  23.61 
 
 		 522 aa  140  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1366  ABC transporter, ATP-binding protein  23.91 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  24 
 
 		 620 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  26.27 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  23.84 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2115  ABC transporter ATPase  23.85 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.199216  normal  0.196946 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  25.82 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  23.31 
 
 		 621 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3303  ABC transporter related protein  24.64 
 
 		 544 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  21.97 
 
 		 623 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  31.19 
 
 		 638 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  23.84 
 
 		 581 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  24.64 
 
 		 606 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  26.19 
 
 		 658 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 		 643 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  23.91 
 
 		 545 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1349  ABC transporter related  25.75 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>