More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0411 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 587 aa  1198    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  39.51 
 
 		 566 aa  430  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  33.79 
 
 		 599 aa  293  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  31.35 
 
 		 625 aa  289  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  29.44 
 
 		 623 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  31.06 
 
 		 596 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  30.07 
 
 		 611 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  30.52 
 
 		 625 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  27.88 
 
 		 621 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  28.43 
 
 		 592 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  28.72 
 
 		 614 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  27.71 
 
 		 621 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  27.71 
 
 		 621 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  28.94 
 
 		 611 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  30.22 
 
 		 604 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  30.15 
 
 		 616 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  27.79 
 
 		 609 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  30.72 
 
 		 618 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  30.24 
 
 		 618 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  29.22 
 
 		 613 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.43 
 
 		 600 aa  251  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  28.45 
 
 		 619 aa  250  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.21 
 
 		 608 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  28.25 
 
 		 625 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  30.75 
 
 		 615 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  30.98 
 
 		 608 aa  240  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  28.33 
 
 		 613 aa  240  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  31.59 
 
 		 615 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  31.56 
 
 		 594 aa  234  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  29.69 
 
 		 591 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 603 aa  231  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.61 
 
 		 603 aa  230  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  26.08 
 
 		 603 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 603 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  29.24 
 
 		 588 aa  226  8e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  28.11 
 
 		 626 aa  226  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  26.72 
 
 		 597 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  29.04 
 
 		 638 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  26.92 
 
 		 626 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  29.8 
 
 		 627 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  27.59 
 
 		 616 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  28.41 
 
 		 623 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  26.36 
 
 		 619 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  27.36 
 
 		 621 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  30.73 
 
 		 618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  31.64 
 
 		 606 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  29.03 
 
 		 608 aa  216  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  28.36 
 
 		 606 aa  216  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  27.41 
 
 		 611 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.08 
 
 		 633 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  27.06 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  29.34 
 
 		 605 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  26.82 
 
 		 605 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  30.09 
 
 		 593 aa  207  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  31.84 
 
 		 622 aa  206  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  26.59 
 
 		 603 aa  205  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  31.69 
 
 		 610 aa  204  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  29.96 
 
 		 595 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  30.43 
 
 		 585 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  27.38 
 
 		 616 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 596 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  26.38 
 
 		 662 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  28.83 
 
 		 586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  29.67 
 
 		 611 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.18 
 
 		 594 aa  196  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  24.01 
 
 		 611 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  31.81 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 608 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  26.21 
 
 		 604 aa  193  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  26.05 
 
 		 626 aa  193  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  32.01 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  28.4 
 
 		 626 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 		 625 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  26.45 
 
 		 578 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  24.79 
 
 		 633 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  24.16 
 
 		 617 aa  187  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 624 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.51 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.51 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.51 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.51 
 
 		 575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.51 
 
 		 575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.51 
 
 		 575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.51 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.11 
 
 		 597 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 		 592 aa  183  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.29 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  29.61 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.08 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.08 
 
 		 593 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.86 
 
 		 583 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0184  ABC transporter, ATP-binding protein  26.38 
 
 		 586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.76 
 
 		 574 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.76 
 
 		 574 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.24 
 
 		 586 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  31.33 
 
 		 568 aa  177  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.64 
 
 		 593 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.64 
 
 		 623 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.64 
 
 		 583 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>