More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1892 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  416  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
202 aa  214  7e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 
205 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.95115e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
205 aa  84.3  1e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.03209e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
205 aa  83.2  2e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  7.42649e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
205 aa  82  6e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 
205 aa  81.6  8e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.4554e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 
205 aa  80.9  1e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
205 aa  80.9  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.65082e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
205 aa  80.9  1e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
205 aa  80.9  1e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
205 aa  80.9  1e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 
205 aa  80.5  2e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.71654e-06  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
206 aa  75.9  4e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
181 aa  72.4  4e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
200 aa  71.6  7e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  29.85 
 
 
195 aa  69.7  3e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 
190 aa  68.2  7e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  24.76 
 
 
197 aa  68.2  8e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  3.19067e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  26.26 
 
 
177 aa  68.2  9e-11  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 
219 aa  66.6  2e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 
192 aa  66.2  3e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  22.99 
 
 
205 aa  65.9  4e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 
193 aa  65.9  4e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  24.62 
 
 
228 aa  64.7  9e-10  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
192 aa  64.3  1e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 
212 aa  63.9  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.5 
 
 
179 aa  63.2  3e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
223 aa  62  7e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 
235 aa  60.1  2e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 
177 aa  60.1  2e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 
184 aa  59.7  3e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 
205 aa  59.3  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
207 aa  57.4  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  25.91 
 
 
207 aa  57.4  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  23.66 
 
 
184 aa  56.6  2e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
181 aa  56.2  3e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 
183 aa  56.2  3e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
179 aa  56.2  3e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  9.0207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  29.78 
 
 
195 aa  55.8  4e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
219 aa  55.8  4e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  21.43 
 
 
181 aa  55.8  4e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  3.7914e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  40.28 
 
 
191 aa  55.8  4e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
181 aa  55.5  5e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
209 aa  55.8  5e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  47.06 
 
 
181 aa  55.5  5e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  47.06 
 
 
181 aa  55.5  6e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 
201 aa  55.1  7e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  23.66 
 
 
184 aa  54.7  9e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  20.85 
 
 
179 aa  54.3  1e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.76333e-05  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  25.6 
 
 
201 aa  54.3  1e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
213 aa  54.3  1e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 
201 aa  53.5  2e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 
182 aa  53.5  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  8.21157e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  41.82 
 
 
180 aa  53.5  2e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
195 aa  52.8  3e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
194 aa  52  5e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  25.12 
 
 
201 aa  52  5e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  2.45724e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
194 aa  52  6e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
211 aa  51.6  8e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
214 aa  51.2  9e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
195 aa  51.2  1e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
178 aa  51.2  1e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  27.27 
 
 
195 aa  51.2  1e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
225 aa  50.1  2e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
497 aa  50.1  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  20.73 
 
 
189 aa  50.1  2e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
184 aa  50.1  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  20.59 
 
 
200 aa  49.7  3e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
218 aa  49.7  3e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
194 aa  49.7  3e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0300  TetR/AcrR family transcriptional regulator  20.71 
 
 
179 aa  49.3  4e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 
184 aa  48.9  5e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
211 aa  48.9  5e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  23.33 
 
 
240 aa  48.9  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  6.67156e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 
212 aa  48.9  6e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
196 aa  48.5  6e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  44.9 
 
 
195 aa  48.5  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
195 aa  48.5  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  26.09 
 
 
184 aa  48.1  9e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
184 aa  48.1  9e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  39.66 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 
185 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  43.75 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  5.68716e-13  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>