More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4249 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 416 aa  793    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  59.76 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  61.64 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  59.01 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  59.25 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  59.25 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  59.25 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  62.65 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  59.41 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  57.92 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  59.29 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  58.93 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  58.18 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  54.84 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  55.07 
 
 		 565 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  55.03 
 
 		 568 aa  338  9e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  57.85 
 
 		 407 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  55.28 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  52.76 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  54.86 
 
 		 386 aa  315  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  58.21 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 422 aa  275  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  41.15 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  41.67 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  41.4 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  41.4 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  41.4 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  41.4 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  41.4 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  41.13 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 368 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.48 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.79 
 
 		 493 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.2 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.54 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.98 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.23 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.55 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.23 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.11 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  26.98 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.34 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.39 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.94 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  25.29 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.49 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 522 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 497 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000774883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.47 
 
 		 511 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 524 aa  56.2  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  22.77 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.81 
 
 		 503 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.44 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 532 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  27.54 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  31.72 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 		 517 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.02 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.6 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.6 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>