208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2704 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2704  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  809    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  52.76 
 
 		 447 aa  349  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  66.75 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  52.39 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  53.72 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  52.93 
 
 		 387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  48.57 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  51.39 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  51.39 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  51.39 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 		 408 aa  301  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  48.4 
 
 		 400 aa  295  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  46.25 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  44.1 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  30.43 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 381 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  28.54 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  32.6 
 
 		 384 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06120  Major Facilitator Superfamily transporter  36 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 465 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.31 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  29.56 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  30.81 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 388 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  28.54 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  31.27 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  28.14 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 391 aa  103  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 436 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  30 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  28.23 
 
 		 502 aa  99.8  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 396 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.73 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.56 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  27.48 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 395 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 389 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 392 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  27.23 
 
 		 383 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  39.88 
 
 		 386 aa  90.5  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 409 aa  90.1  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>