More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1393 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  100 
 
 		 445 aa  862    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  73.01 
 
 		 456 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  66.82 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  62.19 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  61.88 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  63.88 
 
 		 434 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  59.67 
 
 		 459 aa  477  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  63.33 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  56.86 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  60.59 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  61.72 
 
 		 424 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  61.48 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  57.27 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  57.08 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  57.08 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  57.08 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  59.23 
 
 		 478 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  54.39 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  54.67 
 
 		 465 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  56.16 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  58.51 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  60.82 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  60.82 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  60.82 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  54.34 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  62.17 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  57.52 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  56.85 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  56.91 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  55.43 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  54.94 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  58.8 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  58.33 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  55.98 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  57.94 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  54.52 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  54.68 
 
 		 432 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  54.03 
 
 		 451 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  50.23 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  59.33 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  53.85 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  53.16 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  53.35 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  53.38 
 
 		 449 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  52.29 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  49.05 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  49.4 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  52.71 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  51.44 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  53.08 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  47.6 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  48.38 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  51.82 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  47.92 
 
 		 485 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  51.04 
 
 		 464 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  50 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  47.34 
 
 		 489 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.99 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  46.76 
 
 		 410 aa  352  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.76 
 
 		 515 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  47 
 
 		 411 aa  352  7e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  47.02 
 
 		 496 aa  352  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  50.37 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  50.24 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  46.76 
 
 		 410 aa  348  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  46.52 
 
 		 410 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  46.52 
 
 		 410 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  46.52 
 
 		 410 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  48.67 
 
 		 408 aa  346  5e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  49.16 
 
 		 408 aa  346  5e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  46.52 
 
 		 410 aa  345  7e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  49.28 
 
 		 423 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  46.28 
 
 		 410 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  47.92 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  48.18 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  48.33 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  47.02 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  48.55 
 
 		 408 aa  343  5e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  50.73 
 
 		 401 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  45.67 
 
 		 410 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  50.12 
 
 		 402 aa  342  7e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  48.43 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  47.71 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  47.06 
 
 		 513 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  46.29 
 
 		 494 aa  339  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  48.1 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  48.1 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  48.1 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  48.1 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  48.1 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  48.56 
 
 		 431 aa  339  7e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  48.1 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  48.1 
 
 		 478 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  47.27 
 
 		 515 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  48.69 
 
 		 504 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  47.27 
 
 		 524 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  48.1 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  47.62 
 
 		 501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  46.84 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  48.57 
 
 		 500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>