More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2534 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.02 
 
 
257 aa  358  5e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 
238 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
249 aa  198  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
238 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
249 aa  156  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  1.85563e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
222 aa  152  6e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
255 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00108636  hitchhiker  0.000219096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1674  short chain dehydrogenase family protein  35.59 
 
 
247 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
258 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.80386e-05  hitchhiker  4.43735e-07 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
247 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0083444  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
258 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000108179  normal  0.0377265 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2774  short chain dehydrogenase family protein  34.75 
 
 
258 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  hitchhiker  0.000224975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
256 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
257 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0573631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
247 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0183678  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
247 aa  138  8e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0264369  hitchhiker  4.70617e-11 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
247 aa  138  8e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0978937  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
247 aa  138  8e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000349992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
255 aa  136  3e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0196374  unclonable  1.91957e-08 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1372  short chain dehydrogenase family protein  33.05 
 
 
274 aa  134  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0570365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
260 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1221  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.93 
 
 
241 aa  119  4e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
250 aa  110  2e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1335  short chain dehydrogenase family protein  29.29 
 
 
247 aa  109  4e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00551908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 
250 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  34 
 
 
249 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
249 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
249 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  39.39 
 
 
253 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
245 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
247 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  30.24 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  30.12 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 
289 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
240 aa  95.9  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  27.24 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  32.45 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2290  3-hydroxy acid dehydrogenase  32.64 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.46 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  26.17 
 
 
249 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
253 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
254 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00671569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
260 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1376  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  28.79 
 
 
250 aa  89  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
247 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
255 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
257 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  32.12 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  32.12 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  27.6 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 
244 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.17 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0971  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.37 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0977  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  30.3 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.616956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  27.13 
 
 
250 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 
245 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
238 aa  85.5  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  30.46 
 
 
257 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  30.46 
 
 
257 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
247 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  27.6 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
259 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0920  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.98 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
264 aa  84.7  1e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  29.3 
 
 
247 aa  84.7  1e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
258 aa  84.7  1e-15  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0189644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
254 aa  84.7  1e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2130  3-hydroxy acid dehydrogenase  31.96 
 
 
249 aa  84.7  1e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
251 aa  84.3  1e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
256 aa  84.3  1e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>