More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2774 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2774  short chain dehydrogenase family protein  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  hitchhiker  0.000224975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.45 
 
 
258 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.45 
 
 
258 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000108179  normal  0.0377265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1674  short chain dehydrogenase family protein  97.98 
 
 
247 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.09 
 
 
247 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0083444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.09 
 
 
247 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0978937  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.09 
 
 
247 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0264369  hitchhiker  0.0000000000470617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.09 
 
 
247 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000349992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.69 
 
 
247 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0183678  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.97 
 
 
257 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0573631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.11 
 
 
255 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00108636  hitchhiker  0.000219096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.14 
 
 
255 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0196374  unclonable  0.0000000191957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.18 
 
 
256 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1372  short chain dehydrogenase family protein  68.44 
 
 
274 aa  349  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0570365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1335  short chain dehydrogenase family protein  65.16 
 
 
247 aa  337  9e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00551908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
238 aa  191  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
238 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
247 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
222 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
249 aa  125  7e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
260 aa  92  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1221  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.43 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  26.53 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  26.89 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  25.93 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  24.17 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  26.15 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  27.13 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.57 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  28.14 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.240703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  24.59 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.39 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0429  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.81 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.767614  hitchhiker  0.00534124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.51 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  26 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  26.36 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.8 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  25.1 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  28.49 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.64 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  27.92 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  25 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.42 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 
247 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.96 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.87 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.44 
 
 
276 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  25.1 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  26.8 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.89 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.64 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.79 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  24.89 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  26.16 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.42 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.86 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.45 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.69 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  24.22 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.17 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  27.76 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0745  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  29.94 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451524  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  25.31 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  25.62 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  25.6 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  25.62 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.62 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  25.62 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  25.62 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>